RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000434221.5

TTC28-AS1-213, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene TTC28-AS1, Length 972 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-213ENST00000434221 NISCHQ9Y2I1 1504 aa39.86■■■■□ 3.97
TTC28-AS1-213ENST00000434221 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa35.46■■■■□ 3.27
TTC28-AS1-213ENST00000434221 ABCC9O60706 1549 aa34.52■■■■□ 3.12
TTC28-AS1-213ENST00000434221 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa33.26■■■□□ 2.92
TTC28-AS1-213ENST00000434221 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP33.25■■■□□ 2.91
TTC28-AS1-213ENST00000434221 NACADO15069 1562 aa33.22■■■□□ 2.91
TTC28-AS1-213ENST00000434221 DCAF8L2P0C7V8 631 aa33.19■■■□□ 2.9
TTC28-AS1-213ENST00000434221 MYO15BQ96JP2 1530 aa33.02■■■□□ 2.88
TTC28-AS1-213ENST00000434221 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa32.95■■■□□ 2.87
TTC28-AS1-213ENST00000434221 UNC13AQ9UPW8 1703 aa32.69■■■□□ 2.82
TTC28-AS1-213ENST00000434221 SCRIBQ14160 1630 aa32.39■■■□□ 2.78
TTC28-AS1-213ENST00000434221 BICRAQ9NZM4 1560 aa32.28■■■□□ 2.76
TTC28-AS1-213ENST00000434221 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP32.22■■■□□ 2.75
TTC28-AS1-213ENST00000434221 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa31.85■■■□□ 2.69
TTC28-AS1-213ENST00000434221 DNAJC5BQ9UF47 199 aa31.48■■■□□ 2.63
TTC28-AS1-213ENST00000434221 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP31.4■■■□□ 2.62
TTC28-AS1-213ENST00000434221 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa31.26■■■□□ 2.59
TTC28-AS1-213ENST00000434221 CECR2Q9BXF3 1484 aa31.05■■■□□ 2.56
TTC28-AS1-213ENST00000434221 SMARCA4P51532 1647 aa30.96■■■□□ 2.55
TTC28-AS1-213ENST00000434221 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP30.89■■■□□ 2.54
TTC28-AS1-213ENST00000434221 MROH2BQ7Z745 1585 aa30.75■■■□□ 2.51
TTC28-AS1-213ENST00000434221 SMARCA2P51531 1590 aa30.67■■■□□ 2.5
TTC28-AS1-213ENST00000434221 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa30.67■■■□□ 2.5
TTC28-AS1-213ENST00000434221 NCAPD3P42695 1498 aa30.6■■■□□ 2.49
TTC28-AS1-213ENST00000434221 PEG3Q9GZU2 1588 aa30.6■■■□□ 2.49
TTC28-AS1-213ENST00000434221 HMGXB3Q12766 1538 aa30.54■■■□□ 2.48
TTC28-AS1-213ENST00000434221 WIZO95785 1651 aa30.49■■■□□ 2.47
TTC28-AS1-213ENST00000434221 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP30.46■■■□□ 2.47
TTC28-AS1-213ENST00000434221 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP30.39■■■□□ 2.45
TTC28-AS1-213ENST00000434221 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP30.12■■■□□ 2.41
TTC28-AS1-213ENST00000434221 NESP48681 1621 aa29.93■■■□□ 2.38
TTC28-AS1-213ENST00000434221 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa29.86■■■□□ 2.37
TTC28-AS1-213ENST00000434221 ERCC6Q03468 1493 aa29.73■■■□□ 2.35
TTC28-AS1-213ENST00000434221 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP29.72■■■□□ 2.35
TTC28-AS1-213ENST00000434221 CADPSQ9ULU8 1353 aa29.71■■■□□ 2.35
TTC28-AS1-213ENST00000434221 CCDC88BA6NC98 1476 aa29.71■■■□□ 2.35
TTC28-AS1-213ENST00000434221 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa29.69■■■□□ 2.34
TTC28-AS1-213ENST00000434221 PRDM2Q13029 1718 aa29.59■■■□□ 2.33
TTC28-AS1-213ENST00000434221 CFTRP13569 1480 aa29.59■■■□□ 2.33
TTC28-AS1-213ENST00000434221 PDS5BQ9NTI5 1447 aa29.56■■■□□ 2.32
TTC28-AS1-213ENST00000434221 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP29.49■■■□□ 2.31
TTC28-AS1-213ENST00000434221 FANCD2Q9BXW9 1451 aa29.43■■■□□ 2.3
TTC28-AS1-213ENST00000434221 CEP164Q9UPV0 1460 aa29.4■■■□□ 2.3
TTC28-AS1-213ENST00000434221 CUX2O14529 1486 aa29.33■■■□□ 2.29
TTC28-AS1-213ENST00000434221 MRC2Q9UBG0 1479 aa29.32■■■□□ 2.28
TTC28-AS1-213ENST00000434221 WDR62O43379 1518 aa29.24■■■□□ 2.27
TTC28-AS1-213ENST00000434221 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP29.16■■■□□ 2.26
TTC28-AS1-213ENST00000434221 TOPBP1Q92547 1522 aa28.99■■■□□ 2.23
TTC28-AS1-213ENST00000434221 DNMBPQ6XZF7 1577 aa28.99■■■□□ 2.23
TTC28-AS1-213ENST00000434221 ABCC8Q09428 1581 aa28.93■■■□□ 2.22
TTC28-AS1-213ENST00000434221 CUX1P39880 1505 aa28.84■■■□□ 2.21
TTC28-AS1-213ENST00000434221 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP28.75■■■□□ 2.19
TTC28-AS1-213ENST00000434221 IFT140Q96RY7 1462 aa28.73■■■□□ 2.19
TTC28-AS1-213ENST00000434221 FGD5Q6ZNL6 1462 aa28.72■■■□□ 2.19
TTC28-AS1-213ENST00000434221 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP28.71■■■□□ 2.19
TTC28-AS1-213ENST00000434221 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa28.68■■■□□ 2.18
TTC28-AS1-213ENST00000434221 SYNJ1O43426 1573 aa28.67■■■□□ 2.18
TTC28-AS1-213ENST00000434221 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP28.66■■■□□ 2.18
TTC28-AS1-213ENST00000434221 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP28.64■■■□□ 2.18
TTC28-AS1-213ENST00000434221 TOP2BQ02880 1626 aa28.64■■■□□ 2.18
TTC28-AS1-213ENST00000434221 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa28.63■■■□□ 2.17
TTC28-AS1-213ENST00000434221 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP28.61■■■□□ 2.17
TTC28-AS1-213ENST00000434221 SOGA1O94964 1423 aa28.59■■■□□ 2.17
TTC28-AS1-213ENST00000434221 WDR97A6NE52 1622 aa28.58■■■□□ 2.17
TTC28-AS1-213ENST00000434221 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP28.46■■■□□ 2.15
TTC28-AS1-213ENST00000434221 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP28.42■■■□□ 2.14
TTC28-AS1-213ENST00000434221 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa28.4■■■□□ 2.14
TTC28-AS1-213ENST00000434221 PBRM1Q86U86 1689 aa28.38■■■□□ 2.13
TTC28-AS1-213ENST00000434221 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa28.36■■■□□ 2.13
TTC28-AS1-213ENST00000434221 GAPVD1Q14C86 1478 aa28.29■■■□□ 2.12
TTC28-AS1-213ENST00000434221 CHD1O14646 1710 aa28.29■■■□□ 2.12
TTC28-AS1-213ENST00000434221 GRIN2BQ13224 1484 aa28.26■■■□□ 2.11
TTC28-AS1-213ENST00000434221 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa28.25■■■□□ 2.11
TTC28-AS1-213ENST00000434221 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa28.2■■■□□ 2.1
TTC28-AS1-213ENST00000434221 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP28.18■■■□□ 2.1
TTC28-AS1-213ENST00000434221 ERICH3Q5RHP9 1530 aa28.08■■■□□ 2.09
TTC28-AS1-213ENST00000434221 ADAMTS12P58397 1594 aa28.08■■■□□ 2.09
TTC28-AS1-213ENST00000434221 FBLN2P98095 1184 aa28.07■■■□□ 2.08
TTC28-AS1-213ENST00000434221 SYNJ2O15056 1496 aa28.07■■■□□ 2.08
TTC28-AS1-213ENST00000434221 OSCARQ8IYS5 282 aa28.06■■■□□ 2.08
TTC28-AS1-213ENST00000434221 KIF27Q86VH2 1401 aa28.02■■■□□ 2.08
TTC28-AS1-213ENST00000434221 TRIM41Q8WV44 630 aa28.01■■■□□ 2.07
TTC28-AS1-213ENST00000434221 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP27.98■■■□□ 2.07
TTC28-AS1-213ENST00000434221 FHAD1B1AJZ9 1412 aa27.94■■■□□ 2.06
TTC28-AS1-213ENST00000434221 GRIN2AQ12879 1464 aa27.93■■■□□ 2.06
TTC28-AS1-213ENST00000434221 CUL7Q14999 1698 aa27.92■■■□□ 2.06
TTC28-AS1-213ENST00000434221 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa27.88■■■□□ 2.05
TTC28-AS1-213ENST00000434221 CLASP1Q7Z460 1538 aa27.87■■■□□ 2.05
TTC28-AS1-213ENST00000434221 IGF1RP08069 1367 aa27.86■■■□□ 2.05
TTC28-AS1-213ENST00000434221 CEP170Q5SW79 1584 aa27.84■■■□□ 2.05
TTC28-AS1-213ENST00000434221 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa27.78■■■□□ 2.04
TTC28-AS1-213ENST00000434221 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa27.78■■■□□ 2.04
TTC28-AS1-213ENST00000434221 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa27.78■■■□□ 2.04
TTC28-AS1-213ENST00000434221 CHIC1Q5VXU3 224 aa27.77■■■□□ 2.04
TTC28-AS1-213ENST00000434221 NUP160Q12769 1436 aa27.76■■■□□ 2.04
TTC28-AS1-213ENST00000434221 ARHGEF11O15085 1522 aa27.73■■■□□ 2.03
TTC28-AS1-213ENST00000434221 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa27.72■■■□□ 2.03
TTC28-AS1-213ENST00000434221 SHROOM2Q13796 1616 aa27.62■■■□□ 2.01
TTC28-AS1-213ENST00000434221 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa27.6■■■□□ 2.01
TTC28-AS1-213ENST00000434221 EEA1Q15075 1411 aa27.56■■■□□ 2
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