RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000452612.5

TTC28-AS1-217, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3

Gene TTC28-AS1, Length 746 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-217ENST00000452612 NISCHQ9Y2I1 1504 aa32.51■■■□□ 2.8
TTC28-AS1-217ENST00000452612 ABCC9O60706 1549 aa29.19■■■□□ 2.26
TTC28-AS1-217ENST00000452612 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa29.18■■■□□ 2.26
TTC28-AS1-217ENST00000452612 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa27.76■■■□□ 2.03
TTC28-AS1-217ENST00000452612 NACADO15069 1562 aa27.56■■■□□ 2
TTC28-AS1-217ENST00000452612 DCAF8L2P0C7V8 631 aa27.5■■□□□ 1.99
TTC28-AS1-217ENST00000452612 DNAJC5BQ9UF47 199 aa27.34■■□□□ 1.97
TTC28-AS1-217ENST00000452612 UNC13AQ9UPW8 1703 aa27.24■■□□□ 1.95
TTC28-AS1-217ENST00000452612 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP27.19■■□□□ 1.94
TTC28-AS1-217ENST00000452612 MYO15BQ96JP2 1530 aa27.13■■□□□ 1.93
TTC28-AS1-217ENST00000452612 BICRAQ9NZM4 1560 aa26.97■■□□□ 1.91
TTC28-AS1-217ENST00000452612 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP26.95■■□□□ 1.91
TTC28-AS1-217ENST00000452612 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa26.81■■□□□ 1.88
TTC28-AS1-217ENST00000452612 SCRIBQ14160 1630 aa26.65■■□□□ 1.86
TTC28-AS1-217ENST00000452612 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa26.51■■□□□ 1.83
TTC28-AS1-217ENST00000452612 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa26.37■■□□□ 1.81
TTC28-AS1-217ENST00000452612 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP26.3■■□□□ 1.8
TTC28-AS1-217ENST00000452612 CECR2Q9BXF3 1484 aa26.27■■□□□ 1.8
TTC28-AS1-217ENST00000452612 NCAPD3P42695 1498 aa25.42■■□□□ 1.66
TTC28-AS1-217ENST00000452612 SMARCA4P51532 1647 aa25.39■■□□□ 1.66
TTC28-AS1-217ENST00000452612 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa25.37■■□□□ 1.65
TTC28-AS1-217ENST00000452612 SMARCA2P51531 1590 aa25.31■■□□□ 1.64
TTC28-AS1-217ENST00000452612 HMGXB3Q12766 1538 aa25.26■■□□□ 1.63
TTC28-AS1-217ENST00000452612 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
TTC28-AS1-217ENST00000452612 ERCC6Q03468 1493 aa25.19■■□□□ 1.62
TTC28-AS1-217ENST00000452612 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
TTC28-AS1-217ENST00000452612 NESP48681 1621 aa25.09■■□□□ 1.61
TTC28-AS1-217ENST00000452612 PEG3Q9GZU2 1588 aa25.09■■□□□ 1.61
TTC28-AS1-217ENST00000452612 CUX2O14529 1486 aa25.09■■□□□ 1.61
TTC28-AS1-217ENST00000452612 MROH2BQ7Z745 1585 aa25.08■■□□□ 1.61
TTC28-AS1-217ENST00000452612 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa25.04■■□□□ 1.6
TTC28-AS1-217ENST00000452612 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa24.88■■□□□ 1.57
TTC28-AS1-217ENST00000452612 WIZO95785 1651 aa24.83■■□□□ 1.57
TTC28-AS1-217ENST00000452612 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
TTC28-AS1-217ENST00000452612 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa24.81■■□□□ 1.56
TTC28-AS1-217ENST00000452612 PDS5BQ9NTI5 1447 aa24.71■■□□□ 1.55
TTC28-AS1-217ENST00000452612 CADPSQ9ULU8 1353 aa24.67■■□□□ 1.54
TTC28-AS1-217ENST00000452612 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP24.54■■□□□ 1.52
TTC28-AS1-217ENST00000452612 MRC2Q9UBG0 1479 aa24.51■■□□□ 1.51
TTC28-AS1-217ENST00000452612 WDR62O43379 1518 aa24.45■■□□□ 1.51
TTC28-AS1-217ENST00000452612 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP24.45■■□□□ 1.51
TTC28-AS1-217ENST00000452612 CEP164Q9UPV0 1460 aa24.44■■□□□ 1.5
TTC28-AS1-217ENST00000452612 FANCD2Q9BXW9 1451 aa24.41■■□□□ 1.5
TTC28-AS1-217ENST00000452612 CFTRP13569 1480 aa24.38■■□□□ 1.49
TTC28-AS1-217ENST00000452612 PRDM2Q13029 1718 aa24.24■■□□□ 1.47
TTC28-AS1-217ENST00000452612 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
TTC28-AS1-217ENST00000452612 CCDC88BA6NC98 1476 aa24.19■■□□□ 1.46
TTC28-AS1-217ENST00000452612 TRIM41Q8WV44 630 aa24.04■■□□□ 1.44
TTC28-AS1-217ENST00000452612 OSCARQ8IYS5 282 aa23.96■■□□□ 1.43
TTC28-AS1-217ENST00000452612 TOPBP1Q92547 1522 aa23.95■■□□□ 1.43
TTC28-AS1-217ENST00000452612 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP23.93■■□□□ 1.42
TTC28-AS1-217ENST00000452612 IFT140Q96RY7 1462 aa23.93■■□□□ 1.42
TTC28-AS1-217ENST00000452612 DNMBPQ6XZF7 1577 aa23.87■■□□□ 1.41
TTC28-AS1-217ENST00000452612 ABCC8Q09428 1581 aa23.86■■□□□ 1.41
TTC28-AS1-217ENST00000452612 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP23.81■■□□□ 1.4
TTC28-AS1-217ENST00000452612 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP23.74■■□□□ 1.39
TTC28-AS1-217ENST00000452612 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP23.71■■□□□ 1.39
TTC28-AS1-217ENST00000452612 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP23.71■■□□□ 1.39
TTC28-AS1-217ENST00000452612 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa23.7■■□□□ 1.39
TTC28-AS1-217ENST00000452612 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa23.7■■□□□ 1.39
TTC28-AS1-217ENST00000452612 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa23.7■■□□□ 1.39
TTC28-AS1-217ENST00000452612 CHD1O14646 1710 aa23.67■■□□□ 1.38
TTC28-AS1-217ENST00000452612 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa23.65■■□□□ 1.38
TTC28-AS1-217ENST00000452612 ARHGEF11O15085 1522 aa23.6■■□□□ 1.37
TTC28-AS1-217ENST00000452612 SOGA1O94964 1423 aa23.59■■□□□ 1.37
TTC28-AS1-217ENST00000452612 FGD5Q6ZNL6 1462 aa23.58■■□□□ 1.37
TTC28-AS1-217ENST00000452612 FBLN2P98095 1184 aa23.57■■□□□ 1.36
TTC28-AS1-217ENST00000452612 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
TTC28-AS1-217ENST00000452612 CUX1P39880 1505 aa23.56■■□□□ 1.36
TTC28-AS1-217ENST00000452612 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
TTC28-AS1-217ENST00000452612 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa23.47■■□□□ 1.35
TTC28-AS1-217ENST00000452612 WDR97A6NE52 1622 aa23.46■■□□□ 1.35
TTC28-AS1-217ENST00000452612 CYB5RLQ6IPT4 315 aa23.44■■□□□ 1.34
TTC28-AS1-217ENST00000452612 GRIN2BQ13224 1484 aa23.37■■□□□ 1.33
TTC28-AS1-217ENST00000452612 ARAP1Q96P48 1450 aa23.37■■□□□ 1.33
TTC28-AS1-217ENST00000452612 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
TTC28-AS1-217ENST00000452612 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
TTC28-AS1-217ENST00000452612 PBRM1Q86U86 1689 aa23.37■■□□□ 1.33
TTC28-AS1-217ENST00000452612 CLASP1Q7Z460 1538 aa23.33■■□□□ 1.32
TTC28-AS1-217ENST00000452612 SYNJ1O43426 1573 aa23.32■■□□□ 1.32
TTC28-AS1-217ENST00000452612 GAPVD1Q14C86 1478 aa23.31■■□□□ 1.32
TTC28-AS1-217ENST00000452612 SYNJ2O15056 1496 aa23.3■■□□□ 1.32
TTC28-AS1-217ENST00000452612 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa23.28■■□□□ 1.32
TTC28-AS1-217ENST00000452612 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa23.27■■□□□ 1.32
TTC28-AS1-217ENST00000452612 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa23.2■■□□□ 1.3
TTC28-AS1-217ENST00000452612 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP23.19■■□□□ 1.3
TTC28-AS1-217ENST00000452612 TRHP20396 242 aaPredicted RBP23.19■■□□□ 1.3
TTC28-AS1-217ENST00000452612 TOP2BQ02880 1626 aa23.19■■□□□ 1.3
TTC28-AS1-217ENST00000452612 ADAMTS12P58397 1594 aa23.1■■□□□ 1.29
TTC28-AS1-217ENST00000452612 GRIN2AQ12879 1464 aa23.1■■□□□ 1.29
TTC28-AS1-217ENST00000452612 CEP170Q5SW79 1584 aa23.04■■□□□ 1.28
TTC28-AS1-217ENST00000452612 ERCC6L2Q5T890 1561 aa23.01■■□□□ 1.27
TTC28-AS1-217ENST00000452612 FHAD1B1AJZ9 1412 aa23■■□□□ 1.27
TTC28-AS1-217ENST00000452612 NUP160Q12769 1436 aa22.99■■□□□ 1.27
TTC28-AS1-217ENST00000452612 ERICH3Q5RHP9 1530 aa22.99■■□□□ 1.27
TTC28-AS1-217ENST00000452612 SHROOM2Q13796 1616 aa22.91■■□□□ 1.26
TTC28-AS1-217ENST00000452612 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
TTC28-AS1-217ENST00000452612 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa22.77■■□□□ 1.24
TTC28-AS1-217ENST00000452612 JPH4Q96JJ6 628 aa22.77■■□□□ 1.24
TTC28-AS1-217ENST00000452612 KIF27Q86VH2 1401 aa22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 129.7 ms