Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG1

FZD3, Frizzled-3, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD3Q9NPG1 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
FZD3Q9NPG1 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
FZD3Q9NPG1 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
FZD3Q9NPG1 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
FZD3Q9NPG1 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
FZD3Q9NPG1 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
FZD3Q9NPG1 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
FZD3Q9NPG1 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
FZD3Q9NPG1 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
FZD3Q9NPG1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
FZD3Q9NPG1 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
FZD3Q9NPG1 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
FZD3Q9NPG1 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
FZD3Q9NPG1 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
FZD3Q9NPG1 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
FZD3Q9NPG1 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
FZD3Q9NPG1 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
FZD3Q9NPG1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
FZD3Q9NPG1 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
FZD3Q9NPG1 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
FZD3Q9NPG1 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
FZD3Q9NPG1 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
FZD3Q9NPG1 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FZD3Q9NPG1 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FZD3Q9NPG1 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FZD3Q9NPG1 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
FZD3Q9NPG1 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
FZD3Q9NPG1 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
FZD3Q9NPG1 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
FZD3Q9NPG1 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
FZD3Q9NPG1 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
FZD3Q9NPG1 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
FZD3Q9NPG1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
FZD3Q9NPG1 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
FZD3Q9NPG1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
FZD3Q9NPG1 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
FZD3Q9NPG1 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
FZD3Q9NPG1 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
FZD3Q9NPG1 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
FZD3Q9NPG1 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FZD3Q9NPG1 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
FZD3Q9NPG1 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FZD3Q9NPG1 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
FZD3Q9NPG1 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
FZD3Q9NPG1 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FZD3Q9NPG1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
FZD3Q9NPG1 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
FZD3Q9NPG1 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
FZD3Q9NPG1 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
FZD3Q9NPG1 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
FZD3Q9NPG1 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
FZD3Q9NPG1 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
FZD3Q9NPG1 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
FZD3Q9NPG1 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
FZD3Q9NPG1 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
FZD3Q9NPG1 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FZD3Q9NPG1 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FZD3Q9NPG1 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FZD3Q9NPG1 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
FZD3Q9NPG1 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
FZD3Q9NPG1 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FZD3Q9NPG1 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
FZD3Q9NPG1 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
FZD3Q9NPG1 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
FZD3Q9NPG1 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FZD3Q9NPG1 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FZD3Q9NPG1 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FZD3Q9NPG1 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FZD3Q9NPG1 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
FZD3Q9NPG1 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
FZD3Q9NPG1 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
FZD3Q9NPG1 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FZD3Q9NPG1 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
FZD3Q9NPG1 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
FZD3Q9NPG1 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FZD3Q9NPG1 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
FZD3Q9NPG1 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FZD3Q9NPG1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FZD3Q9NPG1 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FZD3Q9NPG1 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FZD3Q9NPG1 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
FZD3Q9NPG1 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
FZD3Q9NPG1 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FZD3Q9NPG1 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
FZD3Q9NPG1 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FZD3Q9NPG1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
FZD3Q9NPG1 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
FZD3Q9NPG1 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
FZD3Q9NPG1 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FZD3Q9NPG1 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
FZD3Q9NPG1 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FZD3Q9NPG1 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26■■□□□ 1.75
FZD3Q9NPG1 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
FZD3Q9NPG1 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FZD3Q9NPG1 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
FZD3Q9NPG1 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FZD3Q9NPG1 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FZD3Q9NPG1 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
FZD3Q9NPG1 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FZD3Q9NPG1 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms