Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPA3

MID1IP1, Mid1-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MID1IP1Q9NPA3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MID1IP1Q9NPA3 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
MID1IP1Q9NPA3 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MID1IP1Q9NPA3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MID1IP1Q9NPA3 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MID1IP1Q9NPA3 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MID1IP1Q9NPA3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MID1IP1Q9NPA3 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MID1IP1Q9NPA3 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MID1IP1Q9NPA3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MID1IP1Q9NPA3 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MID1IP1Q9NPA3 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
MID1IP1Q9NPA3 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MID1IP1Q9NPA3 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MID1IP1Q9NPA3 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MID1IP1Q9NPA3 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MID1IP1Q9NPA3 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
MID1IP1Q9NPA3 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MID1IP1Q9NPA3 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MID1IP1Q9NPA3 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MID1IP1Q9NPA3 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MID1IP1Q9NPA3 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MID1IP1Q9NPA3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MID1IP1Q9NPA3 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MID1IP1Q9NPA3 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MID1IP1Q9NPA3 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MID1IP1Q9NPA3 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MID1IP1Q9NPA3 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MID1IP1Q9NPA3 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MID1IP1Q9NPA3 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MID1IP1Q9NPA3 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MID1IP1Q9NPA3 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MID1IP1Q9NPA3 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MID1IP1Q9NPA3 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MID1IP1Q9NPA3 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
MID1IP1Q9NPA3 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MID1IP1Q9NPA3 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MID1IP1Q9NPA3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MID1IP1Q9NPA3 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MID1IP1Q9NPA3 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MID1IP1Q9NPA3 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
MID1IP1Q9NPA3 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MID1IP1Q9NPA3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MID1IP1Q9NPA3 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MID1IP1Q9NPA3 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MID1IP1Q9NPA3 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MID1IP1Q9NPA3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MID1IP1Q9NPA3 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MID1IP1Q9NPA3 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MID1IP1Q9NPA3 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MID1IP1Q9NPA3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MID1IP1Q9NPA3 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MID1IP1Q9NPA3 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MID1IP1Q9NPA3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MID1IP1Q9NPA3 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MID1IP1Q9NPA3 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MID1IP1Q9NPA3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
MID1IP1Q9NPA3 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MID1IP1Q9NPA3 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MID1IP1Q9NPA3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MID1IP1Q9NPA3 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MID1IP1Q9NPA3 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MID1IP1Q9NPA3 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MID1IP1Q9NPA3 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MID1IP1Q9NPA3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MID1IP1Q9NPA3 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
MID1IP1Q9NPA3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MID1IP1Q9NPA3 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MID1IP1Q9NPA3 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MID1IP1Q9NPA3 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MID1IP1Q9NPA3 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MID1IP1Q9NPA3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MID1IP1Q9NPA3 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MID1IP1Q9NPA3 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MID1IP1Q9NPA3 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MID1IP1Q9NPA3 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MID1IP1Q9NPA3 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MID1IP1Q9NPA3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MID1IP1Q9NPA3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MID1IP1Q9NPA3 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MID1IP1Q9NPA3 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MID1IP1Q9NPA3 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
MID1IP1Q9NPA3 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MID1IP1Q9NPA3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MID1IP1Q9NPA3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MID1IP1Q9NPA3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MID1IP1Q9NPA3 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MID1IP1Q9NPA3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MID1IP1Q9NPA3 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MID1IP1Q9NPA3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MID1IP1Q9NPA3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MID1IP1Q9NPA3 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MID1IP1Q9NPA3 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MID1IP1Q9NPA3 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MID1IP1Q9NPA3 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MID1IP1Q9NPA3 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MID1IP1Q9NPA3 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MID1IP1Q9NPA3 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MID1IP1Q9NPA3 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MID1IP1Q9NPA3 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 138.6 ms