Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP85

NPHS2, Podocin, humanhuman

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHS2Q9NP85 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NPHS2Q9NP85 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NPHS2Q9NP85 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NPHS2Q9NP85 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
NPHS2Q9NP85 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NPHS2Q9NP85 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NPHS2Q9NP85 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NPHS2Q9NP85 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NPHS2Q9NP85 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NPHS2Q9NP85 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NPHS2Q9NP85 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NPHS2Q9NP85 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
NPHS2Q9NP85 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
NPHS2Q9NP85 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NPHS2Q9NP85 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NPHS2Q9NP85 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NPHS2Q9NP85 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NPHS2Q9NP85 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NPHS2Q9NP85 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NPHS2Q9NP85 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NPHS2Q9NP85 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NPHS2Q9NP85 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NPHS2Q9NP85 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NPHS2Q9NP85 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NPHS2Q9NP85 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NPHS2Q9NP85 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NPHS2Q9NP85 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NPHS2Q9NP85 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NPHS2Q9NP85 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NPHS2Q9NP85 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NPHS2Q9NP85 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NPHS2Q9NP85 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.72
NPHS2Q9NP85 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NPHS2Q9NP85 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NPHS2Q9NP85 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NPHS2Q9NP85 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NPHS2Q9NP85 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NPHS2Q9NP85 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NPHS2Q9NP85 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NPHS2Q9NP85 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NPHS2Q9NP85 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NPHS2Q9NP85 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NPHS2Q9NP85 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NPHS2Q9NP85 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NPHS2Q9NP85 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NPHS2Q9NP85 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NPHS2Q9NP85 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NPHS2Q9NP85 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
NPHS2Q9NP85 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NPHS2Q9NP85 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NPHS2Q9NP85 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NPHS2Q9NP85 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NPHS2Q9NP85 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NPHS2Q9NP85 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NPHS2Q9NP85 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NPHS2Q9NP85 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
NPHS2Q9NP85 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NPHS2Q9NP85 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NPHS2Q9NP85 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
NPHS2Q9NP85 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NPHS2Q9NP85 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NPHS2Q9NP85 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NPHS2Q9NP85 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NPHS2Q9NP85 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NPHS2Q9NP85 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NPHS2Q9NP85 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NPHS2Q9NP85 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NPHS2Q9NP85 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NPHS2Q9NP85 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NPHS2Q9NP85 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NPHS2Q9NP85 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NPHS2Q9NP85 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NPHS2Q9NP85 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NPHS2Q9NP85 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NPHS2Q9NP85 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NPHS2Q9NP85 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NPHS2Q9NP85 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NPHS2Q9NP85 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NPHS2Q9NP85 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NPHS2Q9NP85 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NPHS2Q9NP85 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NPHS2Q9NP85 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NPHS2Q9NP85 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NPHS2Q9NP85 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NPHS2Q9NP85 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NPHS2Q9NP85 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NPHS2Q9NP85 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NPHS2Q9NP85 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NPHS2Q9NP85 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NPHS2Q9NP85 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NPHS2Q9NP85 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NPHS2Q9NP85 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NPHS2Q9NP85 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
NPHS2Q9NP85 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NPHS2Q9NP85 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NPHS2Q9NP85 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NPHS2Q9NP85 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NPHS2Q9NP85 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NPHS2Q9NP85 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NPHS2Q9NP85 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms