Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP77

SSU72, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase SSU72, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSU72Q9NP77 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SSU72Q9NP77 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SSU72Q9NP77 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SSU72Q9NP77 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SSU72Q9NP77 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SSU72Q9NP77 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SSU72Q9NP77 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SSU72Q9NP77 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SSU72Q9NP77 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SSU72Q9NP77 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SSU72Q9NP77 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SSU72Q9NP77 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SSU72Q9NP77 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SSU72Q9NP77 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SSU72Q9NP77 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SSU72Q9NP77 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SSU72Q9NP77 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SSU72Q9NP77 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SSU72Q9NP77 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SSU72Q9NP77 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SSU72Q9NP77 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SSU72Q9NP77 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SSU72Q9NP77 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SSU72Q9NP77 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SSU72Q9NP77 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SSU72Q9NP77 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SSU72Q9NP77 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SSU72Q9NP77 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SSU72Q9NP77 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SSU72Q9NP77 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SSU72Q9NP77 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SSU72Q9NP77 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SSU72Q9NP77 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
SSU72Q9NP77 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SSU72Q9NP77 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SSU72Q9NP77 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SSU72Q9NP77 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SSU72Q9NP77 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SSU72Q9NP77 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SSU72Q9NP77 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SSU72Q9NP77 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SSU72Q9NP77 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SSU72Q9NP77 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SSU72Q9NP77 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SSU72Q9NP77 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SSU72Q9NP77 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SSU72Q9NP77 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SSU72Q9NP77 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SSU72Q9NP77 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SSU72Q9NP77 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SSU72Q9NP77 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SSU72Q9NP77 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SSU72Q9NP77 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SSU72Q9NP77 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SSU72Q9NP77 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SSU72Q9NP77 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SSU72Q9NP77 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SSU72Q9NP77 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
SSU72Q9NP77 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SSU72Q9NP77 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SSU72Q9NP77 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SSU72Q9NP77 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SSU72Q9NP77 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SSU72Q9NP77 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SSU72Q9NP77 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SSU72Q9NP77 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SSU72Q9NP77 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SSU72Q9NP77 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SSU72Q9NP77 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SSU72Q9NP77 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SSU72Q9NP77 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
SSU72Q9NP77 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SSU72Q9NP77 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SSU72Q9NP77 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SSU72Q9NP77 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SSU72Q9NP77 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SSU72Q9NP77 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SSU72Q9NP77 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SSU72Q9NP77 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SSU72Q9NP77 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SSU72Q9NP77 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SSU72Q9NP77 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SSU72Q9NP77 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SSU72Q9NP77 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SSU72Q9NP77 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SSU72Q9NP77 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SSU72Q9NP77 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SSU72Q9NP77 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SSU72Q9NP77 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SSU72Q9NP77 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SSU72Q9NP77 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SSU72Q9NP77 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SSU72Q9NP77 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SSU72Q9NP77 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
SSU72Q9NP77 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SSU72Q9NP77 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SSU72Q9NP77 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SSU72Q9NP77 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SSU72Q9NP77 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SSU72Q9NP77 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.8 ms