Protein–RNA interactions for Protein: Q9H987

SYNPO2L, Synaptopodin 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNPO2LQ9H987 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYNPO2LQ9H987 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SYNPO2LQ9H987 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYNPO2LQ9H987 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SYNPO2LQ9H987 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SYNPO2LQ9H987 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SYNPO2LQ9H987 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SYNPO2LQ9H987 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SYNPO2LQ9H987 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYNPO2LQ9H987 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYNPO2LQ9H987 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SYNPO2LQ9H987 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SYNPO2LQ9H987 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYNPO2LQ9H987 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYNPO2LQ9H987 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYNPO2LQ9H987 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYNPO2LQ9H987 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYNPO2LQ9H987 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYNPO2LQ9H987 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYNPO2LQ9H987 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYNPO2LQ9H987 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SYNPO2LQ9H987 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SYNPO2LQ9H987 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SYNPO2LQ9H987 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYNPO2LQ9H987 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYNPO2LQ9H987 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYNPO2LQ9H987 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYNPO2LQ9H987 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYNPO2LQ9H987 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYNPO2LQ9H987 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYNPO2LQ9H987 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYNPO2LQ9H987 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYNPO2LQ9H987 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYNPO2LQ9H987 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYNPO2LQ9H987 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SYNPO2LQ9H987 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SYNPO2LQ9H987 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SYNPO2LQ9H987 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SYNPO2LQ9H987 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SYNPO2LQ9H987 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SYNPO2LQ9H987 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SYNPO2LQ9H987 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SYNPO2LQ9H987 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SYNPO2LQ9H987 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SYNPO2LQ9H987 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SYNPO2LQ9H987 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SYNPO2LQ9H987 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SYNPO2LQ9H987 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYNPO2LQ9H987 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYNPO2LQ9H987 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SYNPO2LQ9H987 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SYNPO2LQ9H987 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SYNPO2LQ9H987 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SYNPO2LQ9H987 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SYNPO2LQ9H987 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SYNPO2LQ9H987 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SYNPO2LQ9H987 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYNPO2LQ9H987 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYNPO2LQ9H987 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYNPO2LQ9H987 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYNPO2LQ9H987 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYNPO2LQ9H987 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYNPO2LQ9H987 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYNPO2LQ9H987 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SYNPO2LQ9H987 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYNPO2LQ9H987 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYNPO2LQ9H987 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYNPO2LQ9H987 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYNPO2LQ9H987 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SYNPO2LQ9H987 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SYNPO2LQ9H987 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SYNPO2LQ9H987 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SYNPO2LQ9H987 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SYNPO2LQ9H987 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SYNPO2LQ9H987 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SYNPO2LQ9H987 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYNPO2LQ9H987 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYNPO2LQ9H987 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SYNPO2LQ9H987 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SYNPO2LQ9H987 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SYNPO2LQ9H987 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SYNPO2LQ9H987 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SYNPO2LQ9H987 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SYNPO2LQ9H987 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SYNPO2LQ9H987 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SYNPO2LQ9H987 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SYNPO2LQ9H987 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SYNPO2LQ9H987 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SYNPO2LQ9H987 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SYNPO2LQ9H987 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SYNPO2LQ9H987 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SYNPO2LQ9H987 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SYNPO2LQ9H987 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SYNPO2LQ9H987 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SYNPO2LQ9H987 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SYNPO2LQ9H987 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SYNPO2LQ9H987 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SYNPO2LQ9H987 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SYNPO2LQ9H987 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SYNPO2LQ9H987 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.6 ms