Protein–RNA interactions for Protein: Q9H8W4

PLEKHF2, Pleckstrin homology domain-containing family F member 2, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLEKHF2Q9H8W4 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PLEKHF2Q9H8W4 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PLEKHF2Q9H8W4 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PLEKHF2Q9H8W4 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PLEKHF2Q9H8W4 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PLEKHF2Q9H8W4 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PLEKHF2Q9H8W4 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PLEKHF2Q9H8W4 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PLEKHF2Q9H8W4 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PLEKHF2Q9H8W4 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PLEKHF2Q9H8W4 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PLEKHF2Q9H8W4 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PLEKHF2Q9H8W4 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
PLEKHF2Q9H8W4 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
PLEKHF2Q9H8W4 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PLEKHF2Q9H8W4 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PLEKHF2Q9H8W4 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PLEKHF2Q9H8W4 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PLEKHF2Q9H8W4 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PLEKHF2Q9H8W4 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PLEKHF2Q9H8W4 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PLEKHF2Q9H8W4 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PLEKHF2Q9H8W4 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PLEKHF2Q9H8W4 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PLEKHF2Q9H8W4 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PLEKHF2Q9H8W4 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PLEKHF2Q9H8W4 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PLEKHF2Q9H8W4 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PLEKHF2Q9H8W4 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PLEKHF2Q9H8W4 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PLEKHF2Q9H8W4 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PLEKHF2Q9H8W4 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PLEKHF2Q9H8W4 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PLEKHF2Q9H8W4 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PLEKHF2Q9H8W4 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PLEKHF2Q9H8W4 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PLEKHF2Q9H8W4 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PLEKHF2Q9H8W4 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PLEKHF2Q9H8W4 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PLEKHF2Q9H8W4 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PLEKHF2Q9H8W4 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PLEKHF2Q9H8W4 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PLEKHF2Q9H8W4 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PLEKHF2Q9H8W4 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PLEKHF2Q9H8W4 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PLEKHF2Q9H8W4 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PLEKHF2Q9H8W4 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PLEKHF2Q9H8W4 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PLEKHF2Q9H8W4 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PLEKHF2Q9H8W4 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PLEKHF2Q9H8W4 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PLEKHF2Q9H8W4 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PLEKHF2Q9H8W4 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PLEKHF2Q9H8W4 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PLEKHF2Q9H8W4 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PLEKHF2Q9H8W4 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PLEKHF2Q9H8W4 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PLEKHF2Q9H8W4 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PLEKHF2Q9H8W4 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PLEKHF2Q9H8W4 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PLEKHF2Q9H8W4 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PLEKHF2Q9H8W4 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PLEKHF2Q9H8W4 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PLEKHF2Q9H8W4 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PLEKHF2Q9H8W4 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PLEKHF2Q9H8W4 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PLEKHF2Q9H8W4 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PLEKHF2Q9H8W4 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PLEKHF2Q9H8W4 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PLEKHF2Q9H8W4 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PLEKHF2Q9H8W4 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PLEKHF2Q9H8W4 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PLEKHF2Q9H8W4 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PLEKHF2Q9H8W4 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PLEKHF2Q9H8W4 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PLEKHF2Q9H8W4 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PLEKHF2Q9H8W4 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PLEKHF2Q9H8W4 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PLEKHF2Q9H8W4 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PLEKHF2Q9H8W4 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PLEKHF2Q9H8W4 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PLEKHF2Q9H8W4 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PLEKHF2Q9H8W4 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PLEKHF2Q9H8W4 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PLEKHF2Q9H8W4 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PLEKHF2Q9H8W4 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PLEKHF2Q9H8W4 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PLEKHF2Q9H8W4 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PLEKHF2Q9H8W4 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PLEKHF2Q9H8W4 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PLEKHF2Q9H8W4 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PLEKHF2Q9H8W4 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PLEKHF2Q9H8W4 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PLEKHF2Q9H8W4 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PLEKHF2Q9H8W4 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PLEKHF2Q9H8W4 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PLEKHF2Q9H8W4 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PLEKHF2Q9H8W4 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PLEKHF2Q9H8W4 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PLEKHF2Q9H8W4 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms