Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SEMA4CQ9C0C4 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SEMA4CQ9C0C4 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SEMA4CQ9C0C4 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SEMA4CQ9C0C4 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SEMA4CQ9C0C4 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SEMA4CQ9C0C4 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SEMA4CQ9C0C4 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SEMA4CQ9C0C4 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SEMA4CQ9C0C4 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SEMA4CQ9C0C4 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SEMA4CQ9C0C4 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SEMA4CQ9C0C4 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SEMA4CQ9C0C4 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SEMA4CQ9C0C4 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SEMA4CQ9C0C4 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SEMA4CQ9C0C4 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SEMA4CQ9C0C4 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SEMA4CQ9C0C4 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SEMA4CQ9C0C4 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SEMA4CQ9C0C4 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SEMA4CQ9C0C4 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SEMA4CQ9C0C4 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SEMA4CQ9C0C4 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SEMA4CQ9C0C4 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SEMA4CQ9C0C4 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SEMA4CQ9C0C4 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SEMA4CQ9C0C4 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SEMA4CQ9C0C4 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SEMA4CQ9C0C4 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SEMA4CQ9C0C4 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SEMA4CQ9C0C4 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SEMA4CQ9C0C4 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SEMA4CQ9C0C4 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SEMA4CQ9C0C4 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SEMA4CQ9C0C4 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SEMA4CQ9C0C4 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SEMA4CQ9C0C4 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SEMA4CQ9C0C4 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SEMA4CQ9C0C4 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SEMA4CQ9C0C4 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SEMA4CQ9C0C4 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SEMA4CQ9C0C4 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SEMA4CQ9C0C4 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SEMA4CQ9C0C4 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SEMA4CQ9C0C4 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SEMA4CQ9C0C4 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SEMA4CQ9C0C4 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SEMA4CQ9C0C4 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SEMA4CQ9C0C4 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SEMA4CQ9C0C4 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SEMA4CQ9C0C4 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SEMA4CQ9C0C4 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SEMA4CQ9C0C4 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SEMA4CQ9C0C4 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SEMA4CQ9C0C4 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SEMA4CQ9C0C4 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SEMA4CQ9C0C4 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SEMA4CQ9C0C4 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SEMA4CQ9C0C4 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SEMA4CQ9C0C4 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SEMA4CQ9C0C4 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SEMA4CQ9C0C4 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SEMA4CQ9C0C4 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SEMA4CQ9C0C4 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SEMA4CQ9C0C4 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SEMA4CQ9C0C4 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SEMA4CQ9C0C4 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SEMA4CQ9C0C4 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SEMA4CQ9C0C4 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SEMA4CQ9C0C4 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SEMA4CQ9C0C4 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SEMA4CQ9C0C4 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SEMA4CQ9C0C4 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SEMA4CQ9C0C4 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SEMA4CQ9C0C4 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SEMA4CQ9C0C4 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SEMA4CQ9C0C4 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SEMA4CQ9C0C4 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SEMA4CQ9C0C4 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SEMA4CQ9C0C4 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SEMA4CQ9C0C4 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SEMA4CQ9C0C4 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SEMA4CQ9C0C4 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SEMA4CQ9C0C4 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SEMA4CQ9C0C4 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SEMA4CQ9C0C4 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SEMA4CQ9C0C4 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SEMA4CQ9C0C4 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SEMA4CQ9C0C4 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SEMA4CQ9C0C4 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SEMA4CQ9C0C4 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SEMA4CQ9C0C4 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SEMA4CQ9C0C4 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SEMA4CQ9C0C4 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SEMA4CQ9C0C4 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SEMA4CQ9C0C4 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SEMA4CQ9C0C4 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SEMA4CQ9C0C4 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SEMA4CQ9C0C4 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms