Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZW5

TM6SF1, Transmembrane 6 superfamily member 1, humanhuman

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM6SF1Q9BZW5 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.27■■■□□ 2.6
TM6SF1Q9BZW5 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
TM6SF1Q9BZW5 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
TM6SF1Q9BZW5 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
TM6SF1Q9BZW5 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
TM6SF1Q9BZW5 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
TM6SF1Q9BZW5 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
TM6SF1Q9BZW5 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
TM6SF1Q9BZW5 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
TM6SF1Q9BZW5 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
TM6SF1Q9BZW5 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
TM6SF1Q9BZW5 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
TM6SF1Q9BZW5 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
TM6SF1Q9BZW5 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
TM6SF1Q9BZW5 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
TM6SF1Q9BZW5 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
TM6SF1Q9BZW5 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
TM6SF1Q9BZW5 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
TM6SF1Q9BZW5 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
TM6SF1Q9BZW5 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
TM6SF1Q9BZW5 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
TM6SF1Q9BZW5 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
TM6SF1Q9BZW5 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
TM6SF1Q9BZW5 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
TM6SF1Q9BZW5 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
TM6SF1Q9BZW5 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
TM6SF1Q9BZW5 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
TM6SF1Q9BZW5 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
TM6SF1Q9BZW5 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
TM6SF1Q9BZW5 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
TM6SF1Q9BZW5 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
TM6SF1Q9BZW5 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
TM6SF1Q9BZW5 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
TM6SF1Q9BZW5 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC31.1■■■□□ 2.57
TM6SF1Q9BZW5 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
TM6SF1Q9BZW5 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
TM6SF1Q9BZW5 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
TM6SF1Q9BZW5 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
TM6SF1Q9BZW5 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
TM6SF1Q9BZW5 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC31.08■■■□□ 2.57
TM6SF1Q9BZW5 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
TM6SF1Q9BZW5 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
TM6SF1Q9BZW5 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
TM6SF1Q9BZW5 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
TM6SF1Q9BZW5 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
TM6SF1Q9BZW5 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
TM6SF1Q9BZW5 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
TM6SF1Q9BZW5 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
TM6SF1Q9BZW5 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
TM6SF1Q9BZW5 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
TM6SF1Q9BZW5 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
TM6SF1Q9BZW5 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
TM6SF1Q9BZW5 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
TM6SF1Q9BZW5 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.02■■■□□ 2.56
TM6SF1Q9BZW5 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC31.01■■■□□ 2.55
TM6SF1Q9BZW5 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
TM6SF1Q9BZW5 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
TM6SF1Q9BZW5 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
TM6SF1Q9BZW5 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
TM6SF1Q9BZW5 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
TM6SF1Q9BZW5 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
TM6SF1Q9BZW5 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
TM6SF1Q9BZW5 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
TM6SF1Q9BZW5 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
TM6SF1Q9BZW5 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
TM6SF1Q9BZW5 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
TM6SF1Q9BZW5 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
TM6SF1Q9BZW5 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
TM6SF1Q9BZW5 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
TM6SF1Q9BZW5 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
TM6SF1Q9BZW5 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
TM6SF1Q9BZW5 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC30.95■■■□□ 2.55
TM6SF1Q9BZW5 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
TM6SF1Q9BZW5 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
TM6SF1Q9BZW5 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
TM6SF1Q9BZW5 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
TM6SF1Q9BZW5 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC30.93■■■□□ 2.54
TM6SF1Q9BZW5 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
TM6SF1Q9BZW5 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
TM6SF1Q9BZW5 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
TM6SF1Q9BZW5 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
TM6SF1Q9BZW5 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
TM6SF1Q9BZW5 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
TM6SF1Q9BZW5 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
TM6SF1Q9BZW5 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
TM6SF1Q9BZW5 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
TM6SF1Q9BZW5 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC30.86■■■□□ 2.53
TM6SF1Q9BZW5 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
TM6SF1Q9BZW5 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
TM6SF1Q9BZW5 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
TM6SF1Q9BZW5 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
TM6SF1Q9BZW5 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
TM6SF1Q9BZW5 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
TM6SF1Q9BZW5 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
TM6SF1Q9BZW5 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
TM6SF1Q9BZW5 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
TM6SF1Q9BZW5 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
TM6SF1Q9BZW5 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
TM6SF1Q9BZW5 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
TM6SF1Q9BZW5 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
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