Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ3

KRTAP9-3, Keratin-associated protein 9-3, humanhuman

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-3Q9BYQ3 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
KRTAP9-3Q9BYQ3 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
KRTAP9-3Q9BYQ3 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
KRTAP9-3Q9BYQ3 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
KRTAP9-3Q9BYQ3 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
KRTAP9-3Q9BYQ3 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
KRTAP9-3Q9BYQ3 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
KRTAP9-3Q9BYQ3 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
KRTAP9-3Q9BYQ3 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
KRTAP9-3Q9BYQ3 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
KRTAP9-3Q9BYQ3 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
KRTAP9-3Q9BYQ3 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
KRTAP9-3Q9BYQ3 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
KRTAP9-3Q9BYQ3 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
KRTAP9-3Q9BYQ3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
KRTAP9-3Q9BYQ3 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
KRTAP9-3Q9BYQ3 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
KRTAP9-3Q9BYQ3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
KRTAP9-3Q9BYQ3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
KRTAP9-3Q9BYQ3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
KRTAP9-3Q9BYQ3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
KRTAP9-3Q9BYQ3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
KRTAP9-3Q9BYQ3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC079416.2-201ENST00000625035 1193 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
KRTAP9-3Q9BYQ3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
KRTAP9-3Q9BYQ3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
KRTAP9-3Q9BYQ3 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
KRTAP9-3Q9BYQ3 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
KRTAP9-3Q9BYQ3 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
KRTAP9-3Q9BYQ3 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
KRTAP9-3Q9BYQ3 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
KRTAP9-3Q9BYQ3 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
KRTAP9-3Q9BYQ3 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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KRTAP9-3Q9BYQ3 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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KRTAP9-3Q9BYQ3 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
KRTAP9-3Q9BYQ3 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
KRTAP9-3Q9BYQ3 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
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KRTAP9-3Q9BYQ3 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
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KRTAP9-3Q9BYQ3 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
KRTAP9-3Q9BYQ3 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
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KRTAP9-3Q9BYQ3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
KRTAP9-3Q9BYQ3 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
KRTAP9-3Q9BYQ3 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
KRTAP9-3Q9BYQ3 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
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KRTAP9-3Q9BYQ3 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
KRTAP9-3Q9BYQ3 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
KRTAP9-3Q9BYQ3 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
KRTAP9-3Q9BYQ3 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
KRTAP9-3Q9BYQ3 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
KRTAP9-3Q9BYQ3 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
KRTAP9-3Q9BYQ3 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
KRTAP9-3Q9BYQ3 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
KRTAP9-3Q9BYQ3 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
KRTAP9-3Q9BYQ3 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
KRTAP9-3Q9BYQ3 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
KRTAP9-3Q9BYQ3 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
KRTAP9-3Q9BYQ3 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
KRTAP9-3Q9BYQ3 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
KRTAP9-3Q9BYQ3 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
KRTAP9-3Q9BYQ3 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
KRTAP9-3Q9BYQ3 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
KRTAP9-3Q9BYQ3 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
KRTAP9-3Q9BYQ3 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
KRTAP9-3Q9BYQ3 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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