Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRP9

Putative uncharacterized protein MGC13053, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9BRP9 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9BRP9 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9BRP9 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9BRP9 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9BRP9 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9BRP9 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9BRP9 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9BRP9 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9BRP9 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9BRP9 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9BRP9 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9BRP9 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9BRP9 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9BRP9 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9BRP9 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Q9BRP9 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9BRP9 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9BRP9 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9BRP9 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9BRP9 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9BRP9 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9BRP9 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9BRP9 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9BRP9 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9BRP9 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9BRP9 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9BRP9 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9BRP9 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9BRP9 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9BRP9 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9BRP9 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9BRP9 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9BRP9 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9BRP9 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9BRP9 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9BRP9 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9BRP9 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9BRP9 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9BRP9 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9BRP9 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9BRP9 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9BRP9 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9BRP9 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9BRP9 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q9BRP9 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q9BRP9 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9BRP9 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9BRP9 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9BRP9 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9BRP9 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9BRP9 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9BRP9 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9BRP9 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9BRP9 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9BRP9 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9BRP9 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9BRP9 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9BRP9 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9BRP9 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9BRP9 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9BRP9 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9BRP9 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9BRP9 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9BRP9 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9BRP9 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9BRP9 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9BRP9 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9BRP9 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9BRP9 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Q9BRP9 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Q9BRP9 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9BRP9 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9BRP9 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9BRP9 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9BRP9 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9BRP9 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9BRP9 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9BRP9 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9BRP9 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9BRP9 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9BRP9 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9BRP9 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9BRP9 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9BRP9 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9BRP9 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9BRP9 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9BRP9 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9BRP9 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9BRP9 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9BRP9 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9BRP9 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9BRP9 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9BRP9 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9BRP9 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9BRP9 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9BRP9 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9BRP9 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9BRP9 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9BRP9 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9BRP9 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms