Protein–RNA interactions for Protein: Q99677

LPAR4, Lysophosphatidic acid receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPAR4Q99677 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LPAR4Q99677 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LPAR4Q99677 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LPAR4Q99677 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LPAR4Q99677 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
LPAR4Q99677 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
LPAR4Q99677 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LPAR4Q99677 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LPAR4Q99677 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
LPAR4Q99677 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LPAR4Q99677 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LPAR4Q99677 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LPAR4Q99677 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LPAR4Q99677 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LPAR4Q99677 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LPAR4Q99677 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LPAR4Q99677 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LPAR4Q99677 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LPAR4Q99677 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LPAR4Q99677 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LPAR4Q99677 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LPAR4Q99677 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LPAR4Q99677 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LPAR4Q99677 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LPAR4Q99677 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LPAR4Q99677 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LPAR4Q99677 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LPAR4Q99677 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LPAR4Q99677 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LPAR4Q99677 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LPAR4Q99677 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
LPAR4Q99677 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LPAR4Q99677 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LPAR4Q99677 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LPAR4Q99677 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LPAR4Q99677 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LPAR4Q99677 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
LPAR4Q99677 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LPAR4Q99677 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LPAR4Q99677 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
LPAR4Q99677 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LPAR4Q99677 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
LPAR4Q99677 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LPAR4Q99677 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LPAR4Q99677 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LPAR4Q99677 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LPAR4Q99677 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LPAR4Q99677 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LPAR4Q99677 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LPAR4Q99677 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LPAR4Q99677 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LPAR4Q99677 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LPAR4Q99677 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LPAR4Q99677 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LPAR4Q99677 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LPAR4Q99677 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LPAR4Q99677 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LPAR4Q99677 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LPAR4Q99677 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LPAR4Q99677 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LPAR4Q99677 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LPAR4Q99677 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LPAR4Q99677 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LPAR4Q99677 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LPAR4Q99677 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
LPAR4Q99677 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LPAR4Q99677 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LPAR4Q99677 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LPAR4Q99677 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LPAR4Q99677 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LPAR4Q99677 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LPAR4Q99677 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LPAR4Q99677 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LPAR4Q99677 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LPAR4Q99677 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LPAR4Q99677 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LPAR4Q99677 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LPAR4Q99677 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LPAR4Q99677 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LPAR4Q99677 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
LPAR4Q99677 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LPAR4Q99677 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LPAR4Q99677 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LPAR4Q99677 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LPAR4Q99677 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LPAR4Q99677 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LPAR4Q99677 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LPAR4Q99677 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LPAR4Q99677 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LPAR4Q99677 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LPAR4Q99677 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
LPAR4Q99677 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LPAR4Q99677 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LPAR4Q99677 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LPAR4Q99677 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LPAR4Q99677 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LPAR4Q99677 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LPAR4Q99677 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LPAR4Q99677 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LPAR4Q99677 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.5 ms