Protein–RNA interactions for Protein: Q96SB3

PPP1R9B, Neurabin-2, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R9BQ96SB3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
PPP1R9BQ96SB3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
PPP1R9BQ96SB3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
PPP1R9BQ96SB3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
PPP1R9BQ96SB3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PPP1R9BQ96SB3 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
PPP1R9BQ96SB3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PPP1R9BQ96SB3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PPP1R9BQ96SB3 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
PPP1R9BQ96SB3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PPP1R9BQ96SB3 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PPP1R9BQ96SB3 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PPP1R9BQ96SB3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PPP1R9BQ96SB3 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
PPP1R9BQ96SB3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
PPP1R9BQ96SB3 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
PPP1R9BQ96SB3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PPP1R9BQ96SB3 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PPP1R9BQ96SB3 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
PPP1R9BQ96SB3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PPP1R9BQ96SB3 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PPP1R9BQ96SB3 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
PPP1R9BQ96SB3 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
PPP1R9BQ96SB3 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
PPP1R9BQ96SB3 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
PPP1R9BQ96SB3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
PPP1R9BQ96SB3 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
PPP1R9BQ96SB3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PPP1R9BQ96SB3 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PPP1R9BQ96SB3 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PPP1R9BQ96SB3 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC29.64■■■□□ 2.33
PPP1R9BQ96SB3 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
PPP1R9BQ96SB3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PPP1R9BQ96SB3 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PPP1R9BQ96SB3 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PPP1R9BQ96SB3 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PPP1R9BQ96SB3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PPP1R9BQ96SB3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PPP1R9BQ96SB3 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PPP1R9BQ96SB3 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PPP1R9BQ96SB3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PPP1R9BQ96SB3 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PPP1R9BQ96SB3 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PPP1R9BQ96SB3 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PPP1R9BQ96SB3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PPP1R9BQ96SB3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PPP1R9BQ96SB3 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PPP1R9BQ96SB3 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PPP1R9BQ96SB3 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PPP1R9BQ96SB3 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PPP1R9BQ96SB3 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PPP1R9BQ96SB3 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
PPP1R9BQ96SB3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PPP1R9BQ96SB3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PPP1R9BQ96SB3 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PPP1R9BQ96SB3 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PPP1R9BQ96SB3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
PPP1R9BQ96SB3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.32
PPP1R9BQ96SB3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
PPP1R9BQ96SB3 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PPP1R9BQ96SB3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PPP1R9BQ96SB3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PPP1R9BQ96SB3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PPP1R9BQ96SB3 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PPP1R9BQ96SB3 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PPP1R9BQ96SB3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PPP1R9BQ96SB3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PPP1R9BQ96SB3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PPP1R9BQ96SB3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PPP1R9BQ96SB3 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PPP1R9BQ96SB3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PPP1R9BQ96SB3 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PPP1R9BQ96SB3 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PPP1R9BQ96SB3 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PPP1R9BQ96SB3 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
PPP1R9BQ96SB3 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
PPP1R9BQ96SB3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PPP1R9BQ96SB3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PPP1R9BQ96SB3 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PPP1R9BQ96SB3 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PPP1R9BQ96SB3 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PPP1R9BQ96SB3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PPP1R9BQ96SB3 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PPP1R9BQ96SB3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PPP1R9BQ96SB3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PPP1R9BQ96SB3 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PPP1R9BQ96SB3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PPP1R9BQ96SB3 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PPP1R9BQ96SB3 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PPP1R9BQ96SB3 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PPP1R9BQ96SB3 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PPP1R9BQ96SB3 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PPP1R9BQ96SB3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC29.39■■■□□ 2.29
PPP1R9BQ96SB3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
PPP1R9BQ96SB3 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PPP1R9BQ96SB3 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PPP1R9BQ96SB3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PPP1R9BQ96SB3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PPP1R9BQ96SB3 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PPP1R9BQ96SB3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms