Protein–RNA interactions for Protein: Q96RT8

TUBGCP5, Gamma-tubulin complex component 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBGCP5Q96RT8 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TUBGCP5Q96RT8 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TUBGCP5Q96RT8 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TUBGCP5Q96RT8 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TUBGCP5Q96RT8 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TUBGCP5Q96RT8 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TUBGCP5Q96RT8 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TUBGCP5Q96RT8 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
TUBGCP5Q96RT8 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
TUBGCP5Q96RT8 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
TUBGCP5Q96RT8 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TUBGCP5Q96RT8 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TUBGCP5Q96RT8 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TUBGCP5Q96RT8 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
TUBGCP5Q96RT8 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TUBGCP5Q96RT8 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TUBGCP5Q96RT8 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TUBGCP5Q96RT8 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TUBGCP5Q96RT8 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TUBGCP5Q96RT8 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TUBGCP5Q96RT8 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TUBGCP5Q96RT8 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TUBGCP5Q96RT8 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TUBGCP5Q96RT8 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TUBGCP5Q96RT8 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TUBGCP5Q96RT8 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TUBGCP5Q96RT8 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TUBGCP5Q96RT8 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TUBGCP5Q96RT8 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TUBGCP5Q96RT8 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TUBGCP5Q96RT8 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TUBGCP5Q96RT8 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TUBGCP5Q96RT8 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TUBGCP5Q96RT8 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TUBGCP5Q96RT8 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TUBGCP5Q96RT8 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TUBGCP5Q96RT8 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TUBGCP5Q96RT8 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TUBGCP5Q96RT8 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
TUBGCP5Q96RT8 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TUBGCP5Q96RT8 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
TUBGCP5Q96RT8 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TUBGCP5Q96RT8 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TUBGCP5Q96RT8 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
TUBGCP5Q96RT8 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
TUBGCP5Q96RT8 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TUBGCP5Q96RT8 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TUBGCP5Q96RT8 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
TUBGCP5Q96RT8 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TUBGCP5Q96RT8 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TUBGCP5Q96RT8 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TUBGCP5Q96RT8 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TUBGCP5Q96RT8 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TUBGCP5Q96RT8 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TUBGCP5Q96RT8 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TUBGCP5Q96RT8 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TUBGCP5Q96RT8 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TUBGCP5Q96RT8 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TUBGCP5Q96RT8 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TUBGCP5Q96RT8 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TUBGCP5Q96RT8 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TUBGCP5Q96RT8 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TUBGCP5Q96RT8 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TUBGCP5Q96RT8 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TUBGCP5Q96RT8 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TUBGCP5Q96RT8 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TUBGCP5Q96RT8 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TUBGCP5Q96RT8 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TUBGCP5Q96RT8 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TUBGCP5Q96RT8 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TUBGCP5Q96RT8 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TUBGCP5Q96RT8 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TUBGCP5Q96RT8 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TUBGCP5Q96RT8 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TUBGCP5Q96RT8 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
TUBGCP5Q96RT8 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
TUBGCP5Q96RT8 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
TUBGCP5Q96RT8 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TUBGCP5Q96RT8 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TUBGCP5Q96RT8 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TUBGCP5Q96RT8 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TUBGCP5Q96RT8 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TUBGCP5Q96RT8 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TUBGCP5Q96RT8 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TUBGCP5Q96RT8 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TUBGCP5Q96RT8 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TUBGCP5Q96RT8 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TUBGCP5Q96RT8 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TUBGCP5Q96RT8 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
TUBGCP5Q96RT8 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TUBGCP5Q96RT8 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TUBGCP5Q96RT8 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
TUBGCP5Q96RT8 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TUBGCP5Q96RT8 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TUBGCP5Q96RT8 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TUBGCP5Q96RT8 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
TUBGCP5Q96RT8 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TUBGCP5Q96RT8 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TUBGCP5Q96RT8 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TUBGCP5Q96RT8 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms