Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SAMD8Q96LT4 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SAMD8Q96LT4 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SAMD8Q96LT4 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SAMD8Q96LT4 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SAMD8Q96LT4 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SAMD8Q96LT4 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SAMD8Q96LT4 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SAMD8Q96LT4 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SAMD8Q96LT4 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SAMD8Q96LT4 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SAMD8Q96LT4 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SAMD8Q96LT4 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SAMD8Q96LT4 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SAMD8Q96LT4 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SAMD8Q96LT4 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SAMD8Q96LT4 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SAMD8Q96LT4 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SAMD8Q96LT4 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SAMD8Q96LT4 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SAMD8Q96LT4 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SAMD8Q96LT4 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SAMD8Q96LT4 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SAMD8Q96LT4 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SAMD8Q96LT4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SAMD8Q96LT4 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SAMD8Q96LT4 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SAMD8Q96LT4 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SAMD8Q96LT4 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SAMD8Q96LT4 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SAMD8Q96LT4 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SAMD8Q96LT4 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SAMD8Q96LT4 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SAMD8Q96LT4 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SAMD8Q96LT4 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SAMD8Q96LT4 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SAMD8Q96LT4 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SAMD8Q96LT4 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SAMD8Q96LT4 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SAMD8Q96LT4 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SAMD8Q96LT4 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SAMD8Q96LT4 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SAMD8Q96LT4 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SAMD8Q96LT4 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SAMD8Q96LT4 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SAMD8Q96LT4 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SAMD8Q96LT4 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SAMD8Q96LT4 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SAMD8Q96LT4 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SAMD8Q96LT4 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SAMD8Q96LT4 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SAMD8Q96LT4 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SAMD8Q96LT4 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SAMD8Q96LT4 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SAMD8Q96LT4 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SAMD8Q96LT4 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SAMD8Q96LT4 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SAMD8Q96LT4 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SAMD8Q96LT4 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SAMD8Q96LT4 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SAMD8Q96LT4 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SAMD8Q96LT4 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SAMD8Q96LT4 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SAMD8Q96LT4 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SAMD8Q96LT4 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SAMD8Q96LT4 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SAMD8Q96LT4 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SAMD8Q96LT4 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SAMD8Q96LT4 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SAMD8Q96LT4 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SAMD8Q96LT4 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SAMD8Q96LT4 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SAMD8Q96LT4 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SAMD8Q96LT4 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SAMD8Q96LT4 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SAMD8Q96LT4 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SAMD8Q96LT4 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SAMD8Q96LT4 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SAMD8Q96LT4 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SAMD8Q96LT4 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SAMD8Q96LT4 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SAMD8Q96LT4 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SAMD8Q96LT4 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SAMD8Q96LT4 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SAMD8Q96LT4 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SAMD8Q96LT4 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SAMD8Q96LT4 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SAMD8Q96LT4 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SAMD8Q96LT4 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SAMD8Q96LT4 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SAMD8Q96LT4 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SAMD8Q96LT4 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SAMD8Q96LT4 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SAMD8Q96LT4 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SAMD8Q96LT4 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SAMD8Q96LT4 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SAMD8Q96LT4 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SAMD8Q96LT4 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SAMD8Q96LT4 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SAMD8Q96LT4 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms