Protein–RNA interactions for Protein: Q96KX1

C4orf36, Uncharacterized protein C4orf36, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf36Q96KX1 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C4orf36Q96KX1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C4orf36Q96KX1 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C4orf36Q96KX1 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C4orf36Q96KX1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C4orf36Q96KX1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C4orf36Q96KX1 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C4orf36Q96KX1 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C4orf36Q96KX1 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C4orf36Q96KX1 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C4orf36Q96KX1 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
C4orf36Q96KX1 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
C4orf36Q96KX1 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C4orf36Q96KX1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
C4orf36Q96KX1 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
C4orf36Q96KX1 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C4orf36Q96KX1 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C4orf36Q96KX1 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C4orf36Q96KX1 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C4orf36Q96KX1 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C4orf36Q96KX1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C4orf36Q96KX1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C4orf36Q96KX1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C4orf36Q96KX1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C4orf36Q96KX1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C4orf36Q96KX1 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C4orf36Q96KX1 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
C4orf36Q96KX1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
C4orf36Q96KX1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C4orf36Q96KX1 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
C4orf36Q96KX1 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C4orf36Q96KX1 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C4orf36Q96KX1 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C4orf36Q96KX1 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
C4orf36Q96KX1 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
C4orf36Q96KX1 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
C4orf36Q96KX1 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C4orf36Q96KX1 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
C4orf36Q96KX1 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C4orf36Q96KX1 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C4orf36Q96KX1 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C4orf36Q96KX1 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C4orf36Q96KX1 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C4orf36Q96KX1 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
C4orf36Q96KX1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
C4orf36Q96KX1 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
C4orf36Q96KX1 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C4orf36Q96KX1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
C4orf36Q96KX1 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
C4orf36Q96KX1 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
C4orf36Q96KX1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
C4orf36Q96KX1 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C4orf36Q96KX1 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
C4orf36Q96KX1 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
C4orf36Q96KX1 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
C4orf36Q96KX1 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
C4orf36Q96KX1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
C4orf36Q96KX1 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
C4orf36Q96KX1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
C4orf36Q96KX1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
C4orf36Q96KX1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
C4orf36Q96KX1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
C4orf36Q96KX1 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
C4orf36Q96KX1 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
C4orf36Q96KX1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C4orf36Q96KX1 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
C4orf36Q96KX1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C4orf36Q96KX1 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
C4orf36Q96KX1 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
C4orf36Q96KX1 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C4orf36Q96KX1 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
C4orf36Q96KX1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C4orf36Q96KX1 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
C4orf36Q96KX1 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
C4orf36Q96KX1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
C4orf36Q96KX1 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C4orf36Q96KX1 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C4orf36Q96KX1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C4orf36Q96KX1 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
C4orf36Q96KX1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
C4orf36Q96KX1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
C4orf36Q96KX1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
C4orf36Q96KX1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
C4orf36Q96KX1 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
C4orf36Q96KX1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
C4orf36Q96KX1 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
C4orf36Q96KX1 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
C4orf36Q96KX1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
C4orf36Q96KX1 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
C4orf36Q96KX1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
C4orf36Q96KX1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
C4orf36Q96KX1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
C4orf36Q96KX1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
C4orf36Q96KX1 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
C4orf36Q96KX1 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
C4orf36Q96KX1 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C4orf36Q96KX1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C4orf36Q96KX1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C4orf36Q96KX1 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C4orf36Q96KX1 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.6 ms