Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB3

HIC2, Hypermethylated in cancer 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIC2Q96JB3 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
HIC2Q96JB3 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
HIC2Q96JB3 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
HIC2Q96JB3 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
HIC2Q96JB3 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HIC2Q96JB3 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
HIC2Q96JB3 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
HIC2Q96JB3 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
HIC2Q96JB3 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HIC2Q96JB3 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
HIC2Q96JB3 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
HIC2Q96JB3 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
HIC2Q96JB3 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HIC2Q96JB3 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HIC2Q96JB3 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HIC2Q96JB3 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
HIC2Q96JB3 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HIC2Q96JB3 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HIC2Q96JB3 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HIC2Q96JB3 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HIC2Q96JB3 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HIC2Q96JB3 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
HIC2Q96JB3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HIC2Q96JB3 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HIC2Q96JB3 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
HIC2Q96JB3 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HIC2Q96JB3 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HIC2Q96JB3 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
HIC2Q96JB3 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HIC2Q96JB3 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HIC2Q96JB3 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HIC2Q96JB3 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HIC2Q96JB3 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HIC2Q96JB3 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HIC2Q96JB3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HIC2Q96JB3 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
HIC2Q96JB3 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
HIC2Q96JB3 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
HIC2Q96JB3 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
HIC2Q96JB3 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
HIC2Q96JB3 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HIC2Q96JB3 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
HIC2Q96JB3 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
HIC2Q96JB3 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
HIC2Q96JB3 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HIC2Q96JB3 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HIC2Q96JB3 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HIC2Q96JB3 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HIC2Q96JB3 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HIC2Q96JB3 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HIC2Q96JB3 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HIC2Q96JB3 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HIC2Q96JB3 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HIC2Q96JB3 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HIC2Q96JB3 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
HIC2Q96JB3 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HIC2Q96JB3 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
HIC2Q96JB3 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
HIC2Q96JB3 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HIC2Q96JB3 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HIC2Q96JB3 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HIC2Q96JB3 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HIC2Q96JB3 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HIC2Q96JB3 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HIC2Q96JB3 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HIC2Q96JB3 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HIC2Q96JB3 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HIC2Q96JB3 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HIC2Q96JB3 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HIC2Q96JB3 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HIC2Q96JB3 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HIC2Q96JB3 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HIC2Q96JB3 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HIC2Q96JB3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HIC2Q96JB3 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HIC2Q96JB3 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HIC2Q96JB3 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
HIC2Q96JB3 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HIC2Q96JB3 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HIC2Q96JB3 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HIC2Q96JB3 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HIC2Q96JB3 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HIC2Q96JB3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HIC2Q96JB3 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
HIC2Q96JB3 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HIC2Q96JB3 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HIC2Q96JB3 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HIC2Q96JB3 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HIC2Q96JB3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HIC2Q96JB3 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HIC2Q96JB3 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
HIC2Q96JB3 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HIC2Q96JB3 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HIC2Q96JB3 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HIC2Q96JB3 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HIC2Q96JB3 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HIC2Q96JB3 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HIC2Q96JB3 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HIC2Q96JB3 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
HIC2Q96JB3 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms