Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ3

CCDC34, Coiled-coil domain-containing protein 34, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC34Q96HJ3 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CCDC34Q96HJ3 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CCDC34Q96HJ3 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC34Q96HJ3 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCDC34Q96HJ3 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCDC34Q96HJ3 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCDC34Q96HJ3 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCDC34Q96HJ3 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCDC34Q96HJ3 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCDC34Q96HJ3 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCDC34Q96HJ3 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCDC34Q96HJ3 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCDC34Q96HJ3 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCDC34Q96HJ3 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
CCDC34Q96HJ3 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CCDC34Q96HJ3 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CCDC34Q96HJ3 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CCDC34Q96HJ3 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CCDC34Q96HJ3 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CCDC34Q96HJ3 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CCDC34Q96HJ3 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CCDC34Q96HJ3 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CCDC34Q96HJ3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CCDC34Q96HJ3 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CCDC34Q96HJ3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CCDC34Q96HJ3 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CCDC34Q96HJ3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CCDC34Q96HJ3 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CCDC34Q96HJ3 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CCDC34Q96HJ3 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CCDC34Q96HJ3 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CCDC34Q96HJ3 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CCDC34Q96HJ3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CCDC34Q96HJ3 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CCDC34Q96HJ3 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CCDC34Q96HJ3 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
CCDC34Q96HJ3 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CCDC34Q96HJ3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CCDC34Q96HJ3 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CCDC34Q96HJ3 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CCDC34Q96HJ3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CCDC34Q96HJ3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CCDC34Q96HJ3 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CCDC34Q96HJ3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CCDC34Q96HJ3 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CCDC34Q96HJ3 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CCDC34Q96HJ3 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CCDC34Q96HJ3 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CCDC34Q96HJ3 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CCDC34Q96HJ3 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CCDC34Q96HJ3 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CCDC34Q96HJ3 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CCDC34Q96HJ3 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CCDC34Q96HJ3 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CCDC34Q96HJ3 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CCDC34Q96HJ3 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
CCDC34Q96HJ3 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CCDC34Q96HJ3 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CCDC34Q96HJ3 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CCDC34Q96HJ3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CCDC34Q96HJ3 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CCDC34Q96HJ3 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CCDC34Q96HJ3 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CCDC34Q96HJ3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CCDC34Q96HJ3 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CCDC34Q96HJ3 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
CCDC34Q96HJ3 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CCDC34Q96HJ3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CCDC34Q96HJ3 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CCDC34Q96HJ3 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CCDC34Q96HJ3 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CCDC34Q96HJ3 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CCDC34Q96HJ3 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CCDC34Q96HJ3 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CCDC34Q96HJ3 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CCDC34Q96HJ3 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CCDC34Q96HJ3 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CCDC34Q96HJ3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CCDC34Q96HJ3 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CCDC34Q96HJ3 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
CCDC34Q96HJ3 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CCDC34Q96HJ3 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CCDC34Q96HJ3 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CCDC34Q96HJ3 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCDC34Q96HJ3 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCDC34Q96HJ3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCDC34Q96HJ3 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CCDC34Q96HJ3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CCDC34Q96HJ3 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CCDC34Q96HJ3 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CCDC34Q96HJ3 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CCDC34Q96HJ3 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CCDC34Q96HJ3 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
CCDC34Q96HJ3 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
CCDC34Q96HJ3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CCDC34Q96HJ3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CCDC34Q96HJ3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CCDC34Q96HJ3 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC34Q96HJ3 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC34Q96HJ3 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms