Protein–RNA interactions for Protein: Q96H35

RBM18, Probable RNA-binding protein 18, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM18Q96H35 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RBM18Q96H35 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
RBM18Q96H35 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RBM18Q96H35 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RBM18Q96H35 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RBM18Q96H35 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RBM18Q96H35 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RBM18Q96H35 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
RBM18Q96H35 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RBM18Q96H35 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RBM18Q96H35 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RBM18Q96H35 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RBM18Q96H35 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RBM18Q96H35 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RBM18Q96H35 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RBM18Q96H35 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
RBM18Q96H35 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RBM18Q96H35 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RBM18Q96H35 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RBM18Q96H35 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RBM18Q96H35 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RBM18Q96H35 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RBM18Q96H35 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RBM18Q96H35 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
RBM18Q96H35 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
RBM18Q96H35 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RBM18Q96H35 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RBM18Q96H35 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RBM18Q96H35 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RBM18Q96H35 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RBM18Q96H35 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RBM18Q96H35 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RBM18Q96H35 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RBM18Q96H35 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RBM18Q96H35 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RBM18Q96H35 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RBM18Q96H35 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RBM18Q96H35 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RBM18Q96H35 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RBM18Q96H35 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RBM18Q96H35 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RBM18Q96H35 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RBM18Q96H35 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RBM18Q96H35 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RBM18Q96H35 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RBM18Q96H35 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RBM18Q96H35 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RBM18Q96H35 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RBM18Q96H35 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RBM18Q96H35 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RBM18Q96H35 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RBM18Q96H35 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RBM18Q96H35 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RBM18Q96H35 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RBM18Q96H35 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RBM18Q96H35 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RBM18Q96H35 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RBM18Q96H35 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
RBM18Q96H35 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RBM18Q96H35 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RBM18Q96H35 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RBM18Q96H35 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RBM18Q96H35 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RBM18Q96H35 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RBM18Q96H35 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RBM18Q96H35 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RBM18Q96H35 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RBM18Q96H35 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RBM18Q96H35 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RBM18Q96H35 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RBM18Q96H35 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RBM18Q96H35 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RBM18Q96H35 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
RBM18Q96H35 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RBM18Q96H35 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RBM18Q96H35 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RBM18Q96H35 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RBM18Q96H35 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RBM18Q96H35 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RBM18Q96H35 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RBM18Q96H35 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RBM18Q96H35 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RBM18Q96H35 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RBM18Q96H35 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RBM18Q96H35 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RBM18Q96H35 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RBM18Q96H35 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RBM18Q96H35 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RBM18Q96H35 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RBM18Q96H35 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RBM18Q96H35 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RBM18Q96H35 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RBM18Q96H35 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RBM18Q96H35 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RBM18Q96H35 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RBM18Q96H35 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RBM18Q96H35 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RBM18Q96H35 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RBM18Q96H35 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RBM18Q96H35 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms