Protein–RNA interactions for Protein: Q96FV3

TSPAN17, Tetraspanin-17, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN17Q96FV3 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TSPAN17Q96FV3 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TSPAN17Q96FV3 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TSPAN17Q96FV3 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TSPAN17Q96FV3 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TSPAN17Q96FV3 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TSPAN17Q96FV3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TSPAN17Q96FV3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TSPAN17Q96FV3 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TSPAN17Q96FV3 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TSPAN17Q96FV3 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TSPAN17Q96FV3 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TSPAN17Q96FV3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TSPAN17Q96FV3 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TSPAN17Q96FV3 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TSPAN17Q96FV3 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TSPAN17Q96FV3 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TSPAN17Q96FV3 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
TSPAN17Q96FV3 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TSPAN17Q96FV3 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TSPAN17Q96FV3 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
TSPAN17Q96FV3 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TSPAN17Q96FV3 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TSPAN17Q96FV3 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TSPAN17Q96FV3 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TSPAN17Q96FV3 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TSPAN17Q96FV3 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TSPAN17Q96FV3 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TSPAN17Q96FV3 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
TSPAN17Q96FV3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
TSPAN17Q96FV3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TSPAN17Q96FV3 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TSPAN17Q96FV3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TSPAN17Q96FV3 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TSPAN17Q96FV3 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TSPAN17Q96FV3 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TSPAN17Q96FV3 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TSPAN17Q96FV3 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TSPAN17Q96FV3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TSPAN17Q96FV3 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TSPAN17Q96FV3 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TSPAN17Q96FV3 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TSPAN17Q96FV3 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TSPAN17Q96FV3 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
TSPAN17Q96FV3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TSPAN17Q96FV3 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TSPAN17Q96FV3 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TSPAN17Q96FV3 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TSPAN17Q96FV3 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
TSPAN17Q96FV3 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
TSPAN17Q96FV3 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TSPAN17Q96FV3 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TSPAN17Q96FV3 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TSPAN17Q96FV3 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TSPAN17Q96FV3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TSPAN17Q96FV3 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TSPAN17Q96FV3 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TSPAN17Q96FV3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TSPAN17Q96FV3 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TSPAN17Q96FV3 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TSPAN17Q96FV3 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TSPAN17Q96FV3 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TSPAN17Q96FV3 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TSPAN17Q96FV3 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
TSPAN17Q96FV3 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TSPAN17Q96FV3 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TSPAN17Q96FV3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TSPAN17Q96FV3 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
TSPAN17Q96FV3 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TSPAN17Q96FV3 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TSPAN17Q96FV3 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TSPAN17Q96FV3 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TSPAN17Q96FV3 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TSPAN17Q96FV3 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TSPAN17Q96FV3 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TSPAN17Q96FV3 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TSPAN17Q96FV3 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
TSPAN17Q96FV3 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TSPAN17Q96FV3 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TSPAN17Q96FV3 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TSPAN17Q96FV3 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TSPAN17Q96FV3 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TSPAN17Q96FV3 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TSPAN17Q96FV3 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TSPAN17Q96FV3 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TSPAN17Q96FV3 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TSPAN17Q96FV3 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TSPAN17Q96FV3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TSPAN17Q96FV3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TSPAN17Q96FV3 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TSPAN17Q96FV3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TSPAN17Q96FV3 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TSPAN17Q96FV3 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TSPAN17Q96FV3 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
TSPAN17Q96FV3 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
TSPAN17Q96FV3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TSPAN17Q96FV3 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.71
TSPAN17Q96FV3 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TSPAN17Q96FV3 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TSPAN17Q96FV3 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms