Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDB4

MGARP, Protein MGARP, humanhuman

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MGARPQ8TDB4 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MGARPQ8TDB4 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
MGARPQ8TDB4 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
MGARPQ8TDB4 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
MGARPQ8TDB4 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
MGARPQ8TDB4 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
MGARPQ8TDB4 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
MGARPQ8TDB4 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MGARPQ8TDB4 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MGARPQ8TDB4 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MGARPQ8TDB4 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MGARPQ8TDB4 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
MGARPQ8TDB4 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
MGARPQ8TDB4 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
MGARPQ8TDB4 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MGARPQ8TDB4 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MGARPQ8TDB4 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
MGARPQ8TDB4 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MGARPQ8TDB4 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MGARPQ8TDB4 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
MGARPQ8TDB4 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
MGARPQ8TDB4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
MGARPQ8TDB4 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
MGARPQ8TDB4 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
MGARPQ8TDB4 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
MGARPQ8TDB4 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
MGARPQ8TDB4 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
MGARPQ8TDB4 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
MGARPQ8TDB4 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
MGARPQ8TDB4 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
MGARPQ8TDB4 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MGARPQ8TDB4 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
MGARPQ8TDB4 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
MGARPQ8TDB4 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
MGARPQ8TDB4 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
MGARPQ8TDB4 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
MGARPQ8TDB4 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
MGARPQ8TDB4 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
MGARPQ8TDB4 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
MGARPQ8TDB4 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
MGARPQ8TDB4 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
MGARPQ8TDB4 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
MGARPQ8TDB4 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
MGARPQ8TDB4 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
MGARPQ8TDB4 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
MGARPQ8TDB4 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
MGARPQ8TDB4 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
MGARPQ8TDB4 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
MGARPQ8TDB4 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
MGARPQ8TDB4 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
MGARPQ8TDB4 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MGARPQ8TDB4 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MGARPQ8TDB4 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MGARPQ8TDB4 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
MGARPQ8TDB4 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MGARPQ8TDB4 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
MGARPQ8TDB4 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
MGARPQ8TDB4 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
MGARPQ8TDB4 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MGARPQ8TDB4 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MGARPQ8TDB4 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MGARPQ8TDB4 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MGARPQ8TDB4 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MGARPQ8TDB4 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MGARPQ8TDB4 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MGARPQ8TDB4 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MGARPQ8TDB4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MGARPQ8TDB4 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MGARPQ8TDB4 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MGARPQ8TDB4 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MGARPQ8TDB4 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MGARPQ8TDB4 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
MGARPQ8TDB4 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
MGARPQ8TDB4 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MGARPQ8TDB4 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MGARPQ8TDB4 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MGARPQ8TDB4 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MGARPQ8TDB4 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MGARPQ8TDB4 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MGARPQ8TDB4 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MGARPQ8TDB4 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MGARPQ8TDB4 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MGARPQ8TDB4 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MGARPQ8TDB4 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MGARPQ8TDB4 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
MGARPQ8TDB4 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MGARPQ8TDB4 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MGARPQ8TDB4 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MGARPQ8TDB4 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MGARPQ8TDB4 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
MGARPQ8TDB4 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MGARPQ8TDB4 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
MGARPQ8TDB4 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MGARPQ8TDB4 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MGARPQ8TDB4 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MGARPQ8TDB4 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.76
MGARPQ8TDB4 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
MGARPQ8TDB4 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MGARPQ8TDB4 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MGARPQ8TDB4 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 686.5 ms