Protein–RNA interactions for Protein: Q8TD47

RPS4Y2, 40S ribosomal protein S4, Y isoform 2, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS4Y2Q8TD47 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RPS4Y2Q8TD47 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RPS4Y2Q8TD47 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RPS4Y2Q8TD47 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPS4Y2Q8TD47 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPS4Y2Q8TD47 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPS4Y2Q8TD47 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPS4Y2Q8TD47 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPS4Y2Q8TD47 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPS4Y2Q8TD47 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPS4Y2Q8TD47 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPS4Y2Q8TD47 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPS4Y2Q8TD47 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPS4Y2Q8TD47 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPS4Y2Q8TD47 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPS4Y2Q8TD47 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RPS4Y2Q8TD47 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RPS4Y2Q8TD47 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RPS4Y2Q8TD47 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RPS4Y2Q8TD47 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPS4Y2Q8TD47 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPS4Y2Q8TD47 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPS4Y2Q8TD47 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPS4Y2Q8TD47 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPS4Y2Q8TD47 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPS4Y2Q8TD47 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPS4Y2Q8TD47 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPS4Y2Q8TD47 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPS4Y2Q8TD47 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPS4Y2Q8TD47 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RPS4Y2Q8TD47 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RPS4Y2Q8TD47 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RPS4Y2Q8TD47 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RPS4Y2Q8TD47 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPS4Y2Q8TD47 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPS4Y2Q8TD47 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPS4Y2Q8TD47 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPS4Y2Q8TD47 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPS4Y2Q8TD47 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPS4Y2Q8TD47 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPS4Y2Q8TD47 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPS4Y2Q8TD47 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPS4Y2Q8TD47 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPS4Y2Q8TD47 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RPS4Y2Q8TD47 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RPS4Y2Q8TD47 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RPS4Y2Q8TD47 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RPS4Y2Q8TD47 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
RPS4Y2Q8TD47 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPS4Y2Q8TD47 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPS4Y2Q8TD47 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPS4Y2Q8TD47 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPS4Y2Q8TD47 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPS4Y2Q8TD47 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPS4Y2Q8TD47 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPS4Y2Q8TD47 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPS4Y2Q8TD47 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPS4Y2Q8TD47 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPS4Y2Q8TD47 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPS4Y2Q8TD47 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPS4Y2Q8TD47 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPS4Y2Q8TD47 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPS4Y2Q8TD47 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPS4Y2Q8TD47 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPS4Y2Q8TD47 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPS4Y2Q8TD47 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPS4Y2Q8TD47 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPS4Y2Q8TD47 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPS4Y2Q8TD47 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPS4Y2Q8TD47 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPS4Y2Q8TD47 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPS4Y2Q8TD47 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPS4Y2Q8TD47 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPS4Y2Q8TD47 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPS4Y2Q8TD47 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPS4Y2Q8TD47 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPS4Y2Q8TD47 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPS4Y2Q8TD47 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPS4Y2Q8TD47 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPS4Y2Q8TD47 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPS4Y2Q8TD47 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPS4Y2Q8TD47 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPS4Y2Q8TD47 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPS4Y2Q8TD47 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPS4Y2Q8TD47 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPS4Y2Q8TD47 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPS4Y2Q8TD47 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPS4Y2Q8TD47 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPS4Y2Q8TD47 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPS4Y2Q8TD47 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RPS4Y2Q8TD47 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPS4Y2Q8TD47 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPS4Y2Q8TD47 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPS4Y2Q8TD47 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPS4Y2Q8TD47 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPS4Y2Q8TD47 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPS4Y2Q8TD47 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPS4Y2Q8TD47 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPS4Y2Q8TD47 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPS4Y2Q8TD47 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.9 ms