Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCN5

PDPR, Pyruvate dehydrogenase phosphatase regulatory subunit, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 879 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDPRQ8NCN5 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PDPRQ8NCN5 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PDPRQ8NCN5 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PDPRQ8NCN5 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PDPRQ8NCN5 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PDPRQ8NCN5 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PDPRQ8NCN5 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PDPRQ8NCN5 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PDPRQ8NCN5 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PDPRQ8NCN5 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PDPRQ8NCN5 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PDPRQ8NCN5 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PDPRQ8NCN5 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PDPRQ8NCN5 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PDPRQ8NCN5 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PDPRQ8NCN5 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PDPRQ8NCN5 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PDPRQ8NCN5 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PDPRQ8NCN5 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PDPRQ8NCN5 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PDPRQ8NCN5 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PDPRQ8NCN5 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PDPRQ8NCN5 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PDPRQ8NCN5 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PDPRQ8NCN5 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PDPRQ8NCN5 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PDPRQ8NCN5 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PDPRQ8NCN5 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PDPRQ8NCN5 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PDPRQ8NCN5 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PDPRQ8NCN5 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PDPRQ8NCN5 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PDPRQ8NCN5 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PDPRQ8NCN5 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PDPRQ8NCN5 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PDPRQ8NCN5 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PDPRQ8NCN5 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PDPRQ8NCN5 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PDPRQ8NCN5 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PDPRQ8NCN5 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PDPRQ8NCN5 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PDPRQ8NCN5 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PDPRQ8NCN5 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDPRQ8NCN5 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDPRQ8NCN5 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDPRQ8NCN5 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDPRQ8NCN5 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDPRQ8NCN5 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDPRQ8NCN5 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
PDPRQ8NCN5 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDPRQ8NCN5 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDPRQ8NCN5 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDPRQ8NCN5 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDPRQ8NCN5 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDPRQ8NCN5 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDPRQ8NCN5 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDPRQ8NCN5 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDPRQ8NCN5 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PDPRQ8NCN5 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDPRQ8NCN5 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDPRQ8NCN5 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDPRQ8NCN5 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDPRQ8NCN5 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDPRQ8NCN5 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDPRQ8NCN5 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDPRQ8NCN5 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDPRQ8NCN5 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDPRQ8NCN5 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
PDPRQ8NCN5 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PDPRQ8NCN5 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDPRQ8NCN5 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDPRQ8NCN5 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDPRQ8NCN5 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDPRQ8NCN5 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDPRQ8NCN5 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDPRQ8NCN5 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDPRQ8NCN5 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDPRQ8NCN5 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDPRQ8NCN5 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDPRQ8NCN5 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PDPRQ8NCN5 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PDPRQ8NCN5 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PDPRQ8NCN5 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDPRQ8NCN5 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDPRQ8NCN5 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDPRQ8NCN5 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDPRQ8NCN5 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDPRQ8NCN5 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDPRQ8NCN5 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDPRQ8NCN5 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PDPRQ8NCN5 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDPRQ8NCN5 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDPRQ8NCN5 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDPRQ8NCN5 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDPRQ8NCN5 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDPRQ8NCN5 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDPRQ8NCN5 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDPRQ8NCN5 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDPRQ8NCN5 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDPRQ8NCN5 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms