Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBF6

AVL9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AVL9Q8NBF6 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
AVL9Q8NBF6 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
AVL9Q8NBF6 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
AVL9Q8NBF6 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
AVL9Q8NBF6 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
AVL9Q8NBF6 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
AVL9Q8NBF6 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
AVL9Q8NBF6 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
AVL9Q8NBF6 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
AVL9Q8NBF6 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
AVL9Q8NBF6 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
AVL9Q8NBF6 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
AVL9Q8NBF6 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
AVL9Q8NBF6 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
AVL9Q8NBF6 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
AVL9Q8NBF6 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
AVL9Q8NBF6 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
AVL9Q8NBF6 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
AVL9Q8NBF6 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
AVL9Q8NBF6 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
AVL9Q8NBF6 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
AVL9Q8NBF6 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
AVL9Q8NBF6 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
AVL9Q8NBF6 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
AVL9Q8NBF6 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
AVL9Q8NBF6 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
AVL9Q8NBF6 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
AVL9Q8NBF6 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
AVL9Q8NBF6 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
AVL9Q8NBF6 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
AVL9Q8NBF6 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
AVL9Q8NBF6 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
AVL9Q8NBF6 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
AVL9Q8NBF6 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
AVL9Q8NBF6 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
AVL9Q8NBF6 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
AVL9Q8NBF6 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
AVL9Q8NBF6 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
AVL9Q8NBF6 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
AVL9Q8NBF6 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
AVL9Q8NBF6 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
AVL9Q8NBF6 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
AVL9Q8NBF6 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
AVL9Q8NBF6 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
AVL9Q8NBF6 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
AVL9Q8NBF6 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
AVL9Q8NBF6 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
AVL9Q8NBF6 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
AVL9Q8NBF6 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
AVL9Q8NBF6 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
AVL9Q8NBF6 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
AVL9Q8NBF6 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
AVL9Q8NBF6 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
AVL9Q8NBF6 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
AVL9Q8NBF6 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
AVL9Q8NBF6 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
AVL9Q8NBF6 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
AVL9Q8NBF6 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
AVL9Q8NBF6 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
AVL9Q8NBF6 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
AVL9Q8NBF6 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
AVL9Q8NBF6 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
AVL9Q8NBF6 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
AVL9Q8NBF6 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
AVL9Q8NBF6 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
AVL9Q8NBF6 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
AVL9Q8NBF6 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
AVL9Q8NBF6 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
AVL9Q8NBF6 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
AVL9Q8NBF6 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
AVL9Q8NBF6 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
AVL9Q8NBF6 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
AVL9Q8NBF6 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
AVL9Q8NBF6 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
AVL9Q8NBF6 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
AVL9Q8NBF6 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
AVL9Q8NBF6 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
AVL9Q8NBF6 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
AVL9Q8NBF6 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
AVL9Q8NBF6 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
AVL9Q8NBF6 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
AVL9Q8NBF6 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
AVL9Q8NBF6 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
AVL9Q8NBF6 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
AVL9Q8NBF6 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
AVL9Q8NBF6 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
AVL9Q8NBF6 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
AVL9Q8NBF6 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
AVL9Q8NBF6 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
AVL9Q8NBF6 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
AVL9Q8NBF6 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
AVL9Q8NBF6 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
AVL9Q8NBF6 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
AVL9Q8NBF6 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
AVL9Q8NBF6 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
AVL9Q8NBF6 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
AVL9Q8NBF6 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
AVL9Q8NBF6 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
AVL9Q8NBF6 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
AVL9Q8NBF6 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms