Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZA3

H1FOO, Histone H1oo, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H1FOOQ8IZA3 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
H1FOOQ8IZA3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
H1FOOQ8IZA3 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
H1FOOQ8IZA3 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
H1FOOQ8IZA3 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
H1FOOQ8IZA3 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
H1FOOQ8IZA3 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
H1FOOQ8IZA3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
H1FOOQ8IZA3 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
H1FOOQ8IZA3 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
H1FOOQ8IZA3 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
H1FOOQ8IZA3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
H1FOOQ8IZA3 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
H1FOOQ8IZA3 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
H1FOOQ8IZA3 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
H1FOOQ8IZA3 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
H1FOOQ8IZA3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
H1FOOQ8IZA3 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
H1FOOQ8IZA3 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
H1FOOQ8IZA3 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
H1FOOQ8IZA3 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
H1FOOQ8IZA3 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
H1FOOQ8IZA3 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
H1FOOQ8IZA3 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
H1FOOQ8IZA3 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
H1FOOQ8IZA3 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
H1FOOQ8IZA3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
H1FOOQ8IZA3 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
H1FOOQ8IZA3 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
H1FOOQ8IZA3 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
H1FOOQ8IZA3 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
H1FOOQ8IZA3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
H1FOOQ8IZA3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
H1FOOQ8IZA3 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
H1FOOQ8IZA3 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
H1FOOQ8IZA3 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
H1FOOQ8IZA3 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
H1FOOQ8IZA3 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
H1FOOQ8IZA3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
H1FOOQ8IZA3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
H1FOOQ8IZA3 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
H1FOOQ8IZA3 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
H1FOOQ8IZA3 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
H1FOOQ8IZA3 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
H1FOOQ8IZA3 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
H1FOOQ8IZA3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
H1FOOQ8IZA3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
H1FOOQ8IZA3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
H1FOOQ8IZA3 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
H1FOOQ8IZA3 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
H1FOOQ8IZA3 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
H1FOOQ8IZA3 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
H1FOOQ8IZA3 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
H1FOOQ8IZA3 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
H1FOOQ8IZA3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
H1FOOQ8IZA3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
H1FOOQ8IZA3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
H1FOOQ8IZA3 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
H1FOOQ8IZA3 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
H1FOOQ8IZA3 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
H1FOOQ8IZA3 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
H1FOOQ8IZA3 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
H1FOOQ8IZA3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
H1FOOQ8IZA3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
H1FOOQ8IZA3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
H1FOOQ8IZA3 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
H1FOOQ8IZA3 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
H1FOOQ8IZA3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
H1FOOQ8IZA3 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
H1FOOQ8IZA3 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
H1FOOQ8IZA3 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
H1FOOQ8IZA3 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
H1FOOQ8IZA3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
H1FOOQ8IZA3 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
H1FOOQ8IZA3 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
H1FOOQ8IZA3 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
H1FOOQ8IZA3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
H1FOOQ8IZA3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
H1FOOQ8IZA3 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
H1FOOQ8IZA3 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
H1FOOQ8IZA3 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
H1FOOQ8IZA3 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
H1FOOQ8IZA3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
H1FOOQ8IZA3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
H1FOOQ8IZA3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
H1FOOQ8IZA3 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
H1FOOQ8IZA3 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
H1FOOQ8IZA3 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
H1FOOQ8IZA3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
H1FOOQ8IZA3 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
H1FOOQ8IZA3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
H1FOOQ8IZA3 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
H1FOOQ8IZA3 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
H1FOOQ8IZA3 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
H1FOOQ8IZA3 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
H1FOOQ8IZA3 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
H1FOOQ8IZA3 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
H1FOOQ8IZA3 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
H1FOOQ8IZA3 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
H1FOOQ8IZA3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms