Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXI2

RHOT1, Mitochondrial Rho GTPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOT1Q8IXI2 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RHOT1Q8IXI2 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RHOT1Q8IXI2 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RHOT1Q8IXI2 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RHOT1Q8IXI2 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RHOT1Q8IXI2 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RHOT1Q8IXI2 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RHOT1Q8IXI2 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
RHOT1Q8IXI2 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RHOT1Q8IXI2 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RHOT1Q8IXI2 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RHOT1Q8IXI2 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RHOT1Q8IXI2 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RHOT1Q8IXI2 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RHOT1Q8IXI2 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RHOT1Q8IXI2 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
RHOT1Q8IXI2 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
RHOT1Q8IXI2 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RHOT1Q8IXI2 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RHOT1Q8IXI2 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RHOT1Q8IXI2 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RHOT1Q8IXI2 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RHOT1Q8IXI2 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RHOT1Q8IXI2 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
RHOT1Q8IXI2 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RHOT1Q8IXI2 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RHOT1Q8IXI2 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RHOT1Q8IXI2 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RHOT1Q8IXI2 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RHOT1Q8IXI2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RHOT1Q8IXI2 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RHOT1Q8IXI2 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RHOT1Q8IXI2 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RHOT1Q8IXI2 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RHOT1Q8IXI2 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RHOT1Q8IXI2 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RHOT1Q8IXI2 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RHOT1Q8IXI2 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RHOT1Q8IXI2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RHOT1Q8IXI2 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RHOT1Q8IXI2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RHOT1Q8IXI2 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RHOT1Q8IXI2 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RHOT1Q8IXI2 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RHOT1Q8IXI2 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RHOT1Q8IXI2 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RHOT1Q8IXI2 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RHOT1Q8IXI2 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RHOT1Q8IXI2 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RHOT1Q8IXI2 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RHOT1Q8IXI2 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RHOT1Q8IXI2 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RHOT1Q8IXI2 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RHOT1Q8IXI2 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RHOT1Q8IXI2 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RHOT1Q8IXI2 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RHOT1Q8IXI2 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RHOT1Q8IXI2 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RHOT1Q8IXI2 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
RHOT1Q8IXI2 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RHOT1Q8IXI2 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RHOT1Q8IXI2 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RHOT1Q8IXI2 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RHOT1Q8IXI2 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RHOT1Q8IXI2 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RHOT1Q8IXI2 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RHOT1Q8IXI2 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RHOT1Q8IXI2 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RHOT1Q8IXI2 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RHOT1Q8IXI2 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RHOT1Q8IXI2 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RHOT1Q8IXI2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RHOT1Q8IXI2 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RHOT1Q8IXI2 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RHOT1Q8IXI2 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RHOT1Q8IXI2 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RHOT1Q8IXI2 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RHOT1Q8IXI2 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RHOT1Q8IXI2 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RHOT1Q8IXI2 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RHOT1Q8IXI2 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RHOT1Q8IXI2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RHOT1Q8IXI2 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RHOT1Q8IXI2 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RHOT1Q8IXI2 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RHOT1Q8IXI2 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
RHOT1Q8IXI2 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RHOT1Q8IXI2 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RHOT1Q8IXI2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RHOT1Q8IXI2 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RHOT1Q8IXI2 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RHOT1Q8IXI2 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RHOT1Q8IXI2 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RHOT1Q8IXI2 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
RHOT1Q8IXI2 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RHOT1Q8IXI2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RHOT1Q8IXI2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RHOT1Q8IXI2 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RHOT1Q8IXI2 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RHOT1Q8IXI2 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms