Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVF7

FMNL3, Formin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,028 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMNL3Q8IVF7 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
FMNL3Q8IVF7 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
FMNL3Q8IVF7 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
FMNL3Q8IVF7 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
FMNL3Q8IVF7 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
FMNL3Q8IVF7 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
FMNL3Q8IVF7 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
FMNL3Q8IVF7 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
FMNL3Q8IVF7 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
FMNL3Q8IVF7 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
FMNL3Q8IVF7 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
FMNL3Q8IVF7 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
FMNL3Q8IVF7 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
FMNL3Q8IVF7 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
FMNL3Q8IVF7 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
FMNL3Q8IVF7 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
FMNL3Q8IVF7 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
FMNL3Q8IVF7 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
FMNL3Q8IVF7 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
FMNL3Q8IVF7 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
FMNL3Q8IVF7 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
FMNL3Q8IVF7 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
FMNL3Q8IVF7 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
FMNL3Q8IVF7 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
FMNL3Q8IVF7 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
FMNL3Q8IVF7 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
FMNL3Q8IVF7 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
FMNL3Q8IVF7 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
FMNL3Q8IVF7 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
FMNL3Q8IVF7 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
FMNL3Q8IVF7 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
FMNL3Q8IVF7 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
FMNL3Q8IVF7 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
FMNL3Q8IVF7 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
FMNL3Q8IVF7 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
FMNL3Q8IVF7 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
FMNL3Q8IVF7 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
FMNL3Q8IVF7 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
FMNL3Q8IVF7 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
FMNL3Q8IVF7 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
FMNL3Q8IVF7 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
FMNL3Q8IVF7 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
FMNL3Q8IVF7 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
FMNL3Q8IVF7 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
FMNL3Q8IVF7 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
FMNL3Q8IVF7 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
FMNL3Q8IVF7 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
FMNL3Q8IVF7 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
FMNL3Q8IVF7 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
FMNL3Q8IVF7 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
FMNL3Q8IVF7 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
FMNL3Q8IVF7 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
FMNL3Q8IVF7 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
FMNL3Q8IVF7 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
FMNL3Q8IVF7 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
FMNL3Q8IVF7 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
FMNL3Q8IVF7 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
FMNL3Q8IVF7 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
FMNL3Q8IVF7 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
FMNL3Q8IVF7 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
FMNL3Q8IVF7 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
FMNL3Q8IVF7 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
FMNL3Q8IVF7 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
FMNL3Q8IVF7 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
FMNL3Q8IVF7 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
FMNL3Q8IVF7 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
FMNL3Q8IVF7 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
FMNL3Q8IVF7 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
FMNL3Q8IVF7 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
FMNL3Q8IVF7 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
FMNL3Q8IVF7 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
FMNL3Q8IVF7 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
FMNL3Q8IVF7 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
FMNL3Q8IVF7 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
FMNL3Q8IVF7 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
FMNL3Q8IVF7 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.07■■■□□ 2.08
FMNL3Q8IVF7 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
FMNL3Q8IVF7 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
FMNL3Q8IVF7 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
FMNL3Q8IVF7 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
FMNL3Q8IVF7 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
FMNL3Q8IVF7 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
FMNL3Q8IVF7 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
FMNL3Q8IVF7 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
FMNL3Q8IVF7 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
FMNL3Q8IVF7 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
FMNL3Q8IVF7 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
FMNL3Q8IVF7 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
FMNL3Q8IVF7 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
FMNL3Q8IVF7 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
FMNL3Q8IVF7 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
FMNL3Q8IVF7 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
FMNL3Q8IVF7 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
FMNL3Q8IVF7 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.01■■■□□ 2.07
FMNL3Q8IVF7 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
FMNL3Q8IVF7 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
FMNL3Q8IVF7 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
FMNL3Q8IVF7 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28■■■□□ 2.07
FMNL3Q8IVF7 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
FMNL3Q8IVF7 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms