Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUG1

KRTAP1-3, Keratin-associated protein 1-3, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP1-3Q8IUG1 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRTAP1-3Q8IUG1 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRTAP1-3Q8IUG1 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRTAP1-3Q8IUG1 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRTAP1-3Q8IUG1 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRTAP1-3Q8IUG1 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRTAP1-3Q8IUG1 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
KRTAP1-3Q8IUG1 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRTAP1-3Q8IUG1 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRTAP1-3Q8IUG1 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRTAP1-3Q8IUG1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRTAP1-3Q8IUG1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRTAP1-3Q8IUG1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRTAP1-3Q8IUG1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRTAP1-3Q8IUG1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRTAP1-3Q8IUG1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRTAP1-3Q8IUG1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRTAP1-3Q8IUG1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRTAP1-3Q8IUG1 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRTAP1-3Q8IUG1 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRTAP1-3Q8IUG1 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRTAP1-3Q8IUG1 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRTAP1-3Q8IUG1 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRTAP1-3Q8IUG1 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRTAP1-3Q8IUG1 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRTAP1-3Q8IUG1 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRTAP1-3Q8IUG1 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRTAP1-3Q8IUG1 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRTAP1-3Q8IUG1 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRTAP1-3Q8IUG1 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRTAP1-3Q8IUG1 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRTAP1-3Q8IUG1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRTAP1-3Q8IUG1 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRTAP1-3Q8IUG1 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRTAP1-3Q8IUG1 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRTAP1-3Q8IUG1 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRTAP1-3Q8IUG1 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRTAP1-3Q8IUG1 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRTAP1-3Q8IUG1 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRTAP1-3Q8IUG1 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
KRTAP1-3Q8IUG1 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRTAP1-3Q8IUG1 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRTAP1-3Q8IUG1 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRTAP1-3Q8IUG1 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRTAP1-3Q8IUG1 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRTAP1-3Q8IUG1 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
KRTAP1-3Q8IUG1 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRTAP1-3Q8IUG1 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRTAP1-3Q8IUG1 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRTAP1-3Q8IUG1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRTAP1-3Q8IUG1 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRTAP1-3Q8IUG1 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRTAP1-3Q8IUG1 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRTAP1-3Q8IUG1 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRTAP1-3Q8IUG1 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRTAP1-3Q8IUG1 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRTAP1-3Q8IUG1 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRTAP1-3Q8IUG1 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRTAP1-3Q8IUG1 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRTAP1-3Q8IUG1 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRTAP1-3Q8IUG1 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRTAP1-3Q8IUG1 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRTAP1-3Q8IUG1 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRTAP1-3Q8IUG1 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRTAP1-3Q8IUG1 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRTAP1-3Q8IUG1 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRTAP1-3Q8IUG1 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRTAP1-3Q8IUG1 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRTAP1-3Q8IUG1 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRTAP1-3Q8IUG1 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRTAP1-3Q8IUG1 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRTAP1-3Q8IUG1 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRTAP1-3Q8IUG1 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRTAP1-3Q8IUG1 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRTAP1-3Q8IUG1 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRTAP1-3Q8IUG1 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRTAP1-3Q8IUG1 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRTAP1-3Q8IUG1 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
KRTAP1-3Q8IUG1 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRTAP1-3Q8IUG1 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRTAP1-3Q8IUG1 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRTAP1-3Q8IUG1 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRTAP1-3Q8IUG1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRTAP1-3Q8IUG1 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRTAP1-3Q8IUG1 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRTAP1-3Q8IUG1 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRTAP1-3Q8IUG1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRTAP1-3Q8IUG1 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRTAP1-3Q8IUG1 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRTAP1-3Q8IUG1 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRTAP1-3Q8IUG1 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
KRTAP1-3Q8IUG1 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRTAP1-3Q8IUG1 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRTAP1-3Q8IUG1 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRTAP1-3Q8IUG1 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRTAP1-3Q8IUG1 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRTAP1-3Q8IUG1 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRTAP1-3Q8IUG1 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRTAP1-3Q8IUG1 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRTAP1-3Q8IUG1 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms