Protein–RNA interactions for Protein: Q86W47

KCNMB4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB4Q86W47 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
KCNMB4Q86W47 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
KCNMB4Q86W47 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
KCNMB4Q86W47 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
KCNMB4Q86W47 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
KCNMB4Q86W47 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
KCNMB4Q86W47 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
KCNMB4Q86W47 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
KCNMB4Q86W47 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
KCNMB4Q86W47 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
KCNMB4Q86W47 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
KCNMB4Q86W47 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
KCNMB4Q86W47 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
KCNMB4Q86W47 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
KCNMB4Q86W47 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
KCNMB4Q86W47 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
KCNMB4Q86W47 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
KCNMB4Q86W47 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
KCNMB4Q86W47 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
KCNMB4Q86W47 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
KCNMB4Q86W47 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
KCNMB4Q86W47 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
KCNMB4Q86W47 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
KCNMB4Q86W47 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
KCNMB4Q86W47 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
KCNMB4Q86W47 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
KCNMB4Q86W47 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
KCNMB4Q86W47 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
KCNMB4Q86W47 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
KCNMB4Q86W47 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
KCNMB4Q86W47 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
KCNMB4Q86W47 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
KCNMB4Q86W47 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
KCNMB4Q86W47 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KCNMB4Q86W47 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KCNMB4Q86W47 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
KCNMB4Q86W47 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
KCNMB4Q86W47 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
KCNMB4Q86W47 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
KCNMB4Q86W47 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KCNMB4Q86W47 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
KCNMB4Q86W47 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
KCNMB4Q86W47 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KCNMB4Q86W47 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
KCNMB4Q86W47 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
KCNMB4Q86W47 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
KCNMB4Q86W47 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KCNMB4Q86W47 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KCNMB4Q86W47 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
KCNMB4Q86W47 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KCNMB4Q86W47 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KCNMB4Q86W47 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KCNMB4Q86W47 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
KCNMB4Q86W47 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
KCNMB4Q86W47 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
KCNMB4Q86W47 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
KCNMB4Q86W47 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
KCNMB4Q86W47 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KCNMB4Q86W47 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
KCNMB4Q86W47 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KCNMB4Q86W47 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KCNMB4Q86W47 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KCNMB4Q86W47 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KCNMB4Q86W47 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KCNMB4Q86W47 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
KCNMB4Q86W47 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
KCNMB4Q86W47 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KCNMB4Q86W47 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KCNMB4Q86W47 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KCNMB4Q86W47 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KCNMB4Q86W47 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KCNMB4Q86W47 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KCNMB4Q86W47 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KCNMB4Q86W47 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
KCNMB4Q86W47 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KCNMB4Q86W47 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KCNMB4Q86W47 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
KCNMB4Q86W47 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KCNMB4Q86W47 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KCNMB4Q86W47 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KCNMB4Q86W47 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
KCNMB4Q86W47 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KCNMB4Q86W47 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
KCNMB4Q86W47 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KCNMB4Q86W47 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KCNMB4Q86W47 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
KCNMB4Q86W47 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
KCNMB4Q86W47 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
KCNMB4Q86W47 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KCNMB4Q86W47 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KCNMB4Q86W47 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KCNMB4Q86W47 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KCNMB4Q86W47 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KCNMB4Q86W47 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
KCNMB4Q86W47 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
KCNMB4Q86W47 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
KCNMB4Q86W47 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KCNMB4Q86W47 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KCNMB4Q86W47 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
KCNMB4Q86W47 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.5 ms