Protein–RNA interactions for Protein: Q86VR2

RETREG3, Reticulophagy regulator 3, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETREG3Q86VR2 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RETREG3Q86VR2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RETREG3Q86VR2 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
RETREG3Q86VR2 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RETREG3Q86VR2 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RETREG3Q86VR2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RETREG3Q86VR2 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RETREG3Q86VR2 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RETREG3Q86VR2 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RETREG3Q86VR2 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RETREG3Q86VR2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RETREG3Q86VR2 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RETREG3Q86VR2 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RETREG3Q86VR2 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RETREG3Q86VR2 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RETREG3Q86VR2 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RETREG3Q86VR2 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RETREG3Q86VR2 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RETREG3Q86VR2 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RETREG3Q86VR2 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RETREG3Q86VR2 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RETREG3Q86VR2 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RETREG3Q86VR2 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RETREG3Q86VR2 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RETREG3Q86VR2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RETREG3Q86VR2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RETREG3Q86VR2 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RETREG3Q86VR2 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RETREG3Q86VR2 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RETREG3Q86VR2 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RETREG3Q86VR2 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RETREG3Q86VR2 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RETREG3Q86VR2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RETREG3Q86VR2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RETREG3Q86VR2 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RETREG3Q86VR2 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RETREG3Q86VR2 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RETREG3Q86VR2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RETREG3Q86VR2 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RETREG3Q86VR2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RETREG3Q86VR2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RETREG3Q86VR2 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RETREG3Q86VR2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
RETREG3Q86VR2 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RETREG3Q86VR2 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RETREG3Q86VR2 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RETREG3Q86VR2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RETREG3Q86VR2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RETREG3Q86VR2 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
RETREG3Q86VR2 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RETREG3Q86VR2 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
RETREG3Q86VR2 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RETREG3Q86VR2 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RETREG3Q86VR2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RETREG3Q86VR2 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RETREG3Q86VR2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RETREG3Q86VR2 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RETREG3Q86VR2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RETREG3Q86VR2 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RETREG3Q86VR2 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RETREG3Q86VR2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RETREG3Q86VR2 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RETREG3Q86VR2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RETREG3Q86VR2 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RETREG3Q86VR2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RETREG3Q86VR2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RETREG3Q86VR2 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RETREG3Q86VR2 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
RETREG3Q86VR2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RETREG3Q86VR2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RETREG3Q86VR2 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RETREG3Q86VR2 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RETREG3Q86VR2 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RETREG3Q86VR2 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RETREG3Q86VR2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RETREG3Q86VR2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RETREG3Q86VR2 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RETREG3Q86VR2 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RETREG3Q86VR2 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RETREG3Q86VR2 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RETREG3Q86VR2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RETREG3Q86VR2 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RETREG3Q86VR2 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RETREG3Q86VR2 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RETREG3Q86VR2 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RETREG3Q86VR2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RETREG3Q86VR2 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RETREG3Q86VR2 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RETREG3Q86VR2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RETREG3Q86VR2 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RETREG3Q86VR2 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RETREG3Q86VR2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RETREG3Q86VR2 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RETREG3Q86VR2 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RETREG3Q86VR2 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RETREG3Q86VR2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RETREG3Q86VR2 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RETREG3Q86VR2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RETREG3Q86VR2 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RETREG3Q86VR2 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms