Protein–RNA interactions for Protein: Q86UP9

LHFPL3, LHFPL tetraspan subfamily member 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHFPL3Q86UP9 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
LHFPL3Q86UP9 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LHFPL3Q86UP9 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
LHFPL3Q86UP9 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LHFPL3Q86UP9 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LHFPL3Q86UP9 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LHFPL3Q86UP9 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LHFPL3Q86UP9 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LHFPL3Q86UP9 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LHFPL3Q86UP9 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LHFPL3Q86UP9 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LHFPL3Q86UP9 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LHFPL3Q86UP9 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LHFPL3Q86UP9 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LHFPL3Q86UP9 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LHFPL3Q86UP9 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LHFPL3Q86UP9 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LHFPL3Q86UP9 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LHFPL3Q86UP9 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LHFPL3Q86UP9 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LHFPL3Q86UP9 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LHFPL3Q86UP9 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LHFPL3Q86UP9 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LHFPL3Q86UP9 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LHFPL3Q86UP9 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LHFPL3Q86UP9 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LHFPL3Q86UP9 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LHFPL3Q86UP9 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LHFPL3Q86UP9 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LHFPL3Q86UP9 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LHFPL3Q86UP9 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LHFPL3Q86UP9 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LHFPL3Q86UP9 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LHFPL3Q86UP9 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LHFPL3Q86UP9 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
LHFPL3Q86UP9 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LHFPL3Q86UP9 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
LHFPL3Q86UP9 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LHFPL3Q86UP9 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LHFPL3Q86UP9 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LHFPL3Q86UP9 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LHFPL3Q86UP9 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LHFPL3Q86UP9 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
LHFPL3Q86UP9 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LHFPL3Q86UP9 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LHFPL3Q86UP9 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LHFPL3Q86UP9 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LHFPL3Q86UP9 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LHFPL3Q86UP9 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LHFPL3Q86UP9 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LHFPL3Q86UP9 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
LHFPL3Q86UP9 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LHFPL3Q86UP9 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LHFPL3Q86UP9 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LHFPL3Q86UP9 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LHFPL3Q86UP9 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LHFPL3Q86UP9 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LHFPL3Q86UP9 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
LHFPL3Q86UP9 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LHFPL3Q86UP9 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LHFPL3Q86UP9 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LHFPL3Q86UP9 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LHFPL3Q86UP9 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LHFPL3Q86UP9 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LHFPL3Q86UP9 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LHFPL3Q86UP9 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LHFPL3Q86UP9 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LHFPL3Q86UP9 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LHFPL3Q86UP9 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LHFPL3Q86UP9 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LHFPL3Q86UP9 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LHFPL3Q86UP9 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LHFPL3Q86UP9 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LHFPL3Q86UP9 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LHFPL3Q86UP9 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LHFPL3Q86UP9 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LHFPL3Q86UP9 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LHFPL3Q86UP9 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LHFPL3Q86UP9 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LHFPL3Q86UP9 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LHFPL3Q86UP9 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LHFPL3Q86UP9 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LHFPL3Q86UP9 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LHFPL3Q86UP9 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
LHFPL3Q86UP9 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LHFPL3Q86UP9 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LHFPL3Q86UP9 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LHFPL3Q86UP9 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LHFPL3Q86UP9 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LHFPL3Q86UP9 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LHFPL3Q86UP9 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LHFPL3Q86UP9 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LHFPL3Q86UP9 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LHFPL3Q86UP9 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LHFPL3Q86UP9 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LHFPL3Q86UP9 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LHFPL3Q86UP9 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LHFPL3Q86UP9 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LHFPL3Q86UP9 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LHFPL3Q86UP9 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms