Protein–RNA interactions for Protein: Q86SE9

PCGF5, Polycomb group RING finger protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF5Q86SE9 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PCGF5Q86SE9 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PCGF5Q86SE9 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PCGF5Q86SE9 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PCGF5Q86SE9 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PCGF5Q86SE9 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PCGF5Q86SE9 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PCGF5Q86SE9 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PCGF5Q86SE9 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PCGF5Q86SE9 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PCGF5Q86SE9 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PCGF5Q86SE9 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PCGF5Q86SE9 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PCGF5Q86SE9 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PCGF5Q86SE9 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
PCGF5Q86SE9 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PCGF5Q86SE9 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PCGF5Q86SE9 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PCGF5Q86SE9 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PCGF5Q86SE9 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PCGF5Q86SE9 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PCGF5Q86SE9 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PCGF5Q86SE9 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PCGF5Q86SE9 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PCGF5Q86SE9 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PCGF5Q86SE9 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PCGF5Q86SE9 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PCGF5Q86SE9 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PCGF5Q86SE9 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PCGF5Q86SE9 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PCGF5Q86SE9 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PCGF5Q86SE9 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PCGF5Q86SE9 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PCGF5Q86SE9 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PCGF5Q86SE9 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PCGF5Q86SE9 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PCGF5Q86SE9 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PCGF5Q86SE9 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PCGF5Q86SE9 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PCGF5Q86SE9 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PCGF5Q86SE9 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PCGF5Q86SE9 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PCGF5Q86SE9 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PCGF5Q86SE9 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
PCGF5Q86SE9 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PCGF5Q86SE9 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PCGF5Q86SE9 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PCGF5Q86SE9 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PCGF5Q86SE9 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PCGF5Q86SE9 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PCGF5Q86SE9 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PCGF5Q86SE9 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PCGF5Q86SE9 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PCGF5Q86SE9 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PCGF5Q86SE9 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PCGF5Q86SE9 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PCGF5Q86SE9 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PCGF5Q86SE9 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PCGF5Q86SE9 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PCGF5Q86SE9 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PCGF5Q86SE9 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PCGF5Q86SE9 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PCGF5Q86SE9 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PCGF5Q86SE9 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PCGF5Q86SE9 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
PCGF5Q86SE9 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PCGF5Q86SE9 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PCGF5Q86SE9 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PCGF5Q86SE9 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
PCGF5Q86SE9 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PCGF5Q86SE9 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PCGF5Q86SE9 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PCGF5Q86SE9 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PCGF5Q86SE9 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PCGF5Q86SE9 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PCGF5Q86SE9 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PCGF5Q86SE9 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PCGF5Q86SE9 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PCGF5Q86SE9 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PCGF5Q86SE9 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PCGF5Q86SE9 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PCGF5Q86SE9 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PCGF5Q86SE9 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PCGF5Q86SE9 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PCGF5Q86SE9 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PCGF5Q86SE9 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PCGF5Q86SE9 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PCGF5Q86SE9 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
PCGF5Q86SE9 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PCGF5Q86SE9 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PCGF5Q86SE9 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PCGF5Q86SE9 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PCGF5Q86SE9 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PCGF5Q86SE9 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PCGF5Q86SE9 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PCGF5Q86SE9 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PCGF5Q86SE9 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PCGF5Q86SE9 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PCGF5Q86SE9 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PCGF5Q86SE9 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms