Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z6E9

RBBP6, E3 ubiquitin-protein ligase RBBP6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,792 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP6Q7Z6E9 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
RBBP6Q7Z6E9 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC30.77■■■□□ 2.52
RBBP6Q7Z6E9 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
RBBP6Q7Z6E9 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
RBBP6Q7Z6E9 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
RBBP6Q7Z6E9 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
RBBP6Q7Z6E9 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
RBBP6Q7Z6E9 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
RBBP6Q7Z6E9 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
RBBP6Q7Z6E9 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
RBBP6Q7Z6E9 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
RBBP6Q7Z6E9 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
RBBP6Q7Z6E9 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
RBBP6Q7Z6E9 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
RBBP6Q7Z6E9 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
RBBP6Q7Z6E9 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
RBBP6Q7Z6E9 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
RBBP6Q7Z6E9 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC30.7■■■□□ 2.51
RBBP6Q7Z6E9 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.5
RBBP6Q7Z6E9 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
RBBP6Q7Z6E9 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
RBBP6Q7Z6E9 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
RBBP6Q7Z6E9 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC30.66■■■□□ 2.5
RBBP6Q7Z6E9 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
RBBP6Q7Z6E9 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
RBBP6Q7Z6E9 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
RBBP6Q7Z6E9 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
RBBP6Q7Z6E9 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
RBBP6Q7Z6E9 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
RBBP6Q7Z6E9 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
RBBP6Q7Z6E9 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC30.6■■■□□ 2.49
RBBP6Q7Z6E9 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
RBBP6Q7Z6E9 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
RBBP6Q7Z6E9 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
RBBP6Q7Z6E9 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
RBBP6Q7Z6E9 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
RBBP6Q7Z6E9 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
RBBP6Q7Z6E9 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
RBBP6Q7Z6E9 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
RBBP6Q7Z6E9 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
RBBP6Q7Z6E9 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
RBBP6Q7Z6E9 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
RBBP6Q7Z6E9 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC30.53■■■□□ 2.48
RBBP6Q7Z6E9 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
RBBP6Q7Z6E9 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
RBBP6Q7Z6E9 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
RBBP6Q7Z6E9 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
RBBP6Q7Z6E9 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
RBBP6Q7Z6E9 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
RBBP6Q7Z6E9 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
RBBP6Q7Z6E9 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
RBBP6Q7Z6E9 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
RBBP6Q7Z6E9 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
RBBP6Q7Z6E9 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
RBBP6Q7Z6E9 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
RBBP6Q7Z6E9 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
RBBP6Q7Z6E9 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC30.48■■■□□ 2.47
RBBP6Q7Z6E9 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
RBBP6Q7Z6E9 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
RBBP6Q7Z6E9 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC30.47■■■□□ 2.47
RBBP6Q7Z6E9 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
RBBP6Q7Z6E9 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC30.46■■■□□ 2.47
RBBP6Q7Z6E9 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
RBBP6Q7Z6E9 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
RBBP6Q7Z6E9 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
RBBP6Q7Z6E9 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
RBBP6Q7Z6E9 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
RBBP6Q7Z6E9 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
RBBP6Q7Z6E9 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC30.45■■■□□ 2.46
RBBP6Q7Z6E9 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
RBBP6Q7Z6E9 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
RBBP6Q7Z6E9 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
RBBP6Q7Z6E9 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
RBBP6Q7Z6E9 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
RBBP6Q7Z6E9 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
RBBP6Q7Z6E9 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
RBBP6Q7Z6E9 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
RBBP6Q7Z6E9 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
RBBP6Q7Z6E9 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
RBBP6Q7Z6E9 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
RBBP6Q7Z6E9 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
RBBP6Q7Z6E9 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
RBBP6Q7Z6E9 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
RBBP6Q7Z6E9 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
RBBP6Q7Z6E9 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
RBBP6Q7Z6E9 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
RBBP6Q7Z6E9 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC30.43■■■□□ 2.46
RBBP6Q7Z6E9 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
RBBP6Q7Z6E9 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
RBBP6Q7Z6E9 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
RBBP6Q7Z6E9 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
RBBP6Q7Z6E9 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
RBBP6Q7Z6E9 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
RBBP6Q7Z6E9 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
RBBP6Q7Z6E9 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
RBBP6Q7Z6E9 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
RBBP6Q7Z6E9 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
RBBP6Q7Z6E9 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
RBBP6Q7Z6E9 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
RBBP6Q7Z6E9 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms