Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRK6

CCDC73, Coiled-coil domain-containing protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC73Q6ZRK6 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CCDC73Q6ZRK6 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CCDC73Q6ZRK6 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CCDC73Q6ZRK6 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CCDC73Q6ZRK6 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CCDC73Q6ZRK6 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CCDC73Q6ZRK6 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CCDC73Q6ZRK6 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CCDC73Q6ZRK6 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
CCDC73Q6ZRK6 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
CCDC73Q6ZRK6 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
CCDC73Q6ZRK6 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
CCDC73Q6ZRK6 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CCDC73Q6ZRK6 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CCDC73Q6ZRK6 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CCDC73Q6ZRK6 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CCDC73Q6ZRK6 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
CCDC73Q6ZRK6 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CCDC73Q6ZRK6 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CCDC73Q6ZRK6 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CCDC73Q6ZRK6 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CCDC73Q6ZRK6 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CCDC73Q6ZRK6 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CCDC73Q6ZRK6 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CCDC73Q6ZRK6 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CCDC73Q6ZRK6 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CCDC73Q6ZRK6 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CCDC73Q6ZRK6 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
CCDC73Q6ZRK6 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CCDC73Q6ZRK6 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CCDC73Q6ZRK6 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.37
CCDC73Q6ZRK6 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CCDC73Q6ZRK6 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CCDC73Q6ZRK6 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CCDC73Q6ZRK6 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CCDC73Q6ZRK6 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
CCDC73Q6ZRK6 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
CCDC73Q6ZRK6 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
CCDC73Q6ZRK6 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CCDC73Q6ZRK6 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CCDC73Q6ZRK6 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CCDC73Q6ZRK6 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CCDC73Q6ZRK6 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CCDC73Q6ZRK6 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CCDC73Q6ZRK6 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CCDC73Q6ZRK6 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CCDC73Q6ZRK6 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CCDC73Q6ZRK6 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CCDC73Q6ZRK6 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CCDC73Q6ZRK6 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CCDC73Q6ZRK6 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CCDC73Q6ZRK6 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CCDC73Q6ZRK6 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CCDC73Q6ZRK6 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CCDC73Q6ZRK6 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CCDC73Q6ZRK6 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CCDC73Q6ZRK6 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CCDC73Q6ZRK6 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CCDC73Q6ZRK6 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CCDC73Q6ZRK6 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CCDC73Q6ZRK6 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CCDC73Q6ZRK6 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CCDC73Q6ZRK6 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.36
CCDC73Q6ZRK6 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
CCDC73Q6ZRK6 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CCDC73Q6ZRK6 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CCDC73Q6ZRK6 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CCDC73Q6ZRK6 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
CCDC73Q6ZRK6 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CCDC73Q6ZRK6 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CCDC73Q6ZRK6 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CCDC73Q6ZRK6 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CCDC73Q6ZRK6 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CCDC73Q6ZRK6 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CCDC73Q6ZRK6 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CCDC73Q6ZRK6 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CCDC73Q6ZRK6 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CCDC73Q6ZRK6 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CCDC73Q6ZRK6 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CCDC73Q6ZRK6 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CCDC73Q6ZRK6 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CCDC73Q6ZRK6 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CCDC73Q6ZRK6 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CCDC73Q6ZRK6 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
CCDC73Q6ZRK6 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CCDC73Q6ZRK6 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CCDC73Q6ZRK6 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CCDC73Q6ZRK6 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CCDC73Q6ZRK6 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CCDC73Q6ZRK6 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CCDC73Q6ZRK6 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CCDC73Q6ZRK6 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CCDC73Q6ZRK6 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CCDC73Q6ZRK6 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CCDC73Q6ZRK6 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CCDC73Q6ZRK6 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CCDC73Q6ZRK6 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CCDC73Q6ZRK6 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CCDC73Q6ZRK6 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CCDC73Q6ZRK6 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.8 ms