Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMJ2

SCARA5, Scavenger receptor class A member 5, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARA5Q6ZMJ2 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
SCARA5Q6ZMJ2 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SCARA5Q6ZMJ2 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SCARA5Q6ZMJ2 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SCARA5Q6ZMJ2 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SCARA5Q6ZMJ2 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SCARA5Q6ZMJ2 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SCARA5Q6ZMJ2 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SCARA5Q6ZMJ2 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SCARA5Q6ZMJ2 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SCARA5Q6ZMJ2 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SCARA5Q6ZMJ2 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SCARA5Q6ZMJ2 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SCARA5Q6ZMJ2 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SCARA5Q6ZMJ2 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SCARA5Q6ZMJ2 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
SCARA5Q6ZMJ2 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SCARA5Q6ZMJ2 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SCARA5Q6ZMJ2 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
SCARA5Q6ZMJ2 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SCARA5Q6ZMJ2 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
SCARA5Q6ZMJ2 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SCARA5Q6ZMJ2 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SCARA5Q6ZMJ2 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SCARA5Q6ZMJ2 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SCARA5Q6ZMJ2 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SCARA5Q6ZMJ2 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
SCARA5Q6ZMJ2 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SCARA5Q6ZMJ2 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SCARA5Q6ZMJ2 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SCARA5Q6ZMJ2 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SCARA5Q6ZMJ2 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SCARA5Q6ZMJ2 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SCARA5Q6ZMJ2 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SCARA5Q6ZMJ2 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SCARA5Q6ZMJ2 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SCARA5Q6ZMJ2 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
SCARA5Q6ZMJ2 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SCARA5Q6ZMJ2 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SCARA5Q6ZMJ2 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SCARA5Q6ZMJ2 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SCARA5Q6ZMJ2 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SCARA5Q6ZMJ2 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SCARA5Q6ZMJ2 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SCARA5Q6ZMJ2 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SCARA5Q6ZMJ2 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SCARA5Q6ZMJ2 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SCARA5Q6ZMJ2 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SCARA5Q6ZMJ2 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SCARA5Q6ZMJ2 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SCARA5Q6ZMJ2 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SCARA5Q6ZMJ2 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SCARA5Q6ZMJ2 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SCARA5Q6ZMJ2 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SCARA5Q6ZMJ2 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SCARA5Q6ZMJ2 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SCARA5Q6ZMJ2 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SCARA5Q6ZMJ2 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SCARA5Q6ZMJ2 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SCARA5Q6ZMJ2 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SCARA5Q6ZMJ2 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SCARA5Q6ZMJ2 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SCARA5Q6ZMJ2 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SCARA5Q6ZMJ2 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SCARA5Q6ZMJ2 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SCARA5Q6ZMJ2 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SCARA5Q6ZMJ2 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SCARA5Q6ZMJ2 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SCARA5Q6ZMJ2 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SCARA5Q6ZMJ2 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SCARA5Q6ZMJ2 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SCARA5Q6ZMJ2 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SCARA5Q6ZMJ2 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SCARA5Q6ZMJ2 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SCARA5Q6ZMJ2 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SCARA5Q6ZMJ2 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SCARA5Q6ZMJ2 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
SCARA5Q6ZMJ2 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SCARA5Q6ZMJ2 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SCARA5Q6ZMJ2 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
SCARA5Q6ZMJ2 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SCARA5Q6ZMJ2 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SCARA5Q6ZMJ2 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SCARA5Q6ZMJ2 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SCARA5Q6ZMJ2 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SCARA5Q6ZMJ2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SCARA5Q6ZMJ2 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SCARA5Q6ZMJ2 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SCARA5Q6ZMJ2 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SCARA5Q6ZMJ2 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SCARA5Q6ZMJ2 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SCARA5Q6ZMJ2 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SCARA5Q6ZMJ2 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
SCARA5Q6ZMJ2 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SCARA5Q6ZMJ2 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SCARA5Q6ZMJ2 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
SCARA5Q6ZMJ2 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SCARA5Q6ZMJ2 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SCARA5Q6ZMJ2 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SCARA5Q6ZMJ2 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms