Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWN0

LYPD4, Ly6/PLAUR domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYPD4Q6UWN0 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LYPD4Q6UWN0 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LYPD4Q6UWN0 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LYPD4Q6UWN0 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LYPD4Q6UWN0 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
LYPD4Q6UWN0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LYPD4Q6UWN0 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LYPD4Q6UWN0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LYPD4Q6UWN0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LYPD4Q6UWN0 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LYPD4Q6UWN0 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LYPD4Q6UWN0 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
LYPD4Q6UWN0 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LYPD4Q6UWN0 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LYPD4Q6UWN0 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LYPD4Q6UWN0 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LYPD4Q6UWN0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LYPD4Q6UWN0 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
LYPD4Q6UWN0 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LYPD4Q6UWN0 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LYPD4Q6UWN0 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LYPD4Q6UWN0 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LYPD4Q6UWN0 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LYPD4Q6UWN0 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LYPD4Q6UWN0 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LYPD4Q6UWN0 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LYPD4Q6UWN0 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LYPD4Q6UWN0 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LYPD4Q6UWN0 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LYPD4Q6UWN0 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LYPD4Q6UWN0 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
LYPD4Q6UWN0 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LYPD4Q6UWN0 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LYPD4Q6UWN0 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LYPD4Q6UWN0 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LYPD4Q6UWN0 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LYPD4Q6UWN0 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LYPD4Q6UWN0 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LYPD4Q6UWN0 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LYPD4Q6UWN0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LYPD4Q6UWN0 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LYPD4Q6UWN0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LYPD4Q6UWN0 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LYPD4Q6UWN0 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LYPD4Q6UWN0 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LYPD4Q6UWN0 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LYPD4Q6UWN0 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LYPD4Q6UWN0 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LYPD4Q6UWN0 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LYPD4Q6UWN0 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LYPD4Q6UWN0 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LYPD4Q6UWN0 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LYPD4Q6UWN0 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LYPD4Q6UWN0 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LYPD4Q6UWN0 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LYPD4Q6UWN0 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LYPD4Q6UWN0 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LYPD4Q6UWN0 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LYPD4Q6UWN0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LYPD4Q6UWN0 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LYPD4Q6UWN0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LYPD4Q6UWN0 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LYPD4Q6UWN0 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LYPD4Q6UWN0 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LYPD4Q6UWN0 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LYPD4Q6UWN0 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LYPD4Q6UWN0 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LYPD4Q6UWN0 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LYPD4Q6UWN0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LYPD4Q6UWN0 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LYPD4Q6UWN0 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LYPD4Q6UWN0 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LYPD4Q6UWN0 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
LYPD4Q6UWN0 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
LYPD4Q6UWN0 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LYPD4Q6UWN0 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LYPD4Q6UWN0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LYPD4Q6UWN0 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LYPD4Q6UWN0 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
LYPD4Q6UWN0 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LYPD4Q6UWN0 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LYPD4Q6UWN0 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LYPD4Q6UWN0 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
LYPD4Q6UWN0 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
LYPD4Q6UWN0 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LYPD4Q6UWN0 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LYPD4Q6UWN0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LYPD4Q6UWN0 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LYPD4Q6UWN0 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LYPD4Q6UWN0 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LYPD4Q6UWN0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LYPD4Q6UWN0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LYPD4Q6UWN0 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LYPD4Q6UWN0 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LYPD4Q6UWN0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LYPD4Q6UWN0 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LYPD4Q6UWN0 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LYPD4Q6UWN0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LYPD4Q6UWN0 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LYPD4Q6UWN0 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms