Protein–RNA interactions for Protein: Q6STE5

SMARCD3, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD3Q6STE5 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SMARCD3Q6STE5 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SMARCD3Q6STE5 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SMARCD3Q6STE5 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SMARCD3Q6STE5 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SMARCD3Q6STE5 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SMARCD3Q6STE5 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SMARCD3Q6STE5 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SMARCD3Q6STE5 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SMARCD3Q6STE5 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SMARCD3Q6STE5 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMARCD3Q6STE5 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMARCD3Q6STE5 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMARCD3Q6STE5 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMARCD3Q6STE5 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMARCD3Q6STE5 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMARCD3Q6STE5 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SMARCD3Q6STE5 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMARCD3Q6STE5 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMARCD3Q6STE5 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMARCD3Q6STE5 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMARCD3Q6STE5 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMARCD3Q6STE5 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SMARCD3Q6STE5 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMARCD3Q6STE5 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMARCD3Q6STE5 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMARCD3Q6STE5 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMARCD3Q6STE5 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMARCD3Q6STE5 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SMARCD3Q6STE5 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMARCD3Q6STE5 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMARCD3Q6STE5 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMARCD3Q6STE5 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMARCD3Q6STE5 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMARCD3Q6STE5 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMARCD3Q6STE5 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMARCD3Q6STE5 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMARCD3Q6STE5 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMARCD3Q6STE5 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMARCD3Q6STE5 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMARCD3Q6STE5 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMARCD3Q6STE5 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMARCD3Q6STE5 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMARCD3Q6STE5 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMARCD3Q6STE5 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SMARCD3Q6STE5 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SMARCD3Q6STE5 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMARCD3Q6STE5 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMARCD3Q6STE5 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMARCD3Q6STE5 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMARCD3Q6STE5 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMARCD3Q6STE5 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMARCD3Q6STE5 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMARCD3Q6STE5 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMARCD3Q6STE5 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SMARCD3Q6STE5 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SMARCD3Q6STE5 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SMARCD3Q6STE5 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SMARCD3Q6STE5 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SMARCD3Q6STE5 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMARCD3Q6STE5 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMARCD3Q6STE5 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMARCD3Q6STE5 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMARCD3Q6STE5 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMARCD3Q6STE5 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMARCD3Q6STE5 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMARCD3Q6STE5 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMARCD3Q6STE5 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMARCD3Q6STE5 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMARCD3Q6STE5 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMARCD3Q6STE5 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMARCD3Q6STE5 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMARCD3Q6STE5 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMARCD3Q6STE5 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMARCD3Q6STE5 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMARCD3Q6STE5 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMARCD3Q6STE5 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMARCD3Q6STE5 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMARCD3Q6STE5 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SMARCD3Q6STE5 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMARCD3Q6STE5 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMARCD3Q6STE5 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMARCD3Q6STE5 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMARCD3Q6STE5 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMARCD3Q6STE5 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMARCD3Q6STE5 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMARCD3Q6STE5 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SMARCD3Q6STE5 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMARCD3Q6STE5 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMARCD3Q6STE5 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMARCD3Q6STE5 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMARCD3Q6STE5 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMARCD3Q6STE5 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMARCD3Q6STE5 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMARCD3Q6STE5 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMARCD3Q6STE5 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMARCD3Q6STE5 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMARCD3Q6STE5 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMARCD3Q6STE5 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMARCD3Q6STE5 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 190.5 ms