Protein–RNA interactions for Protein: Q6IC98

GRAMD4, GRAM domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD4Q6IC98 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
GRAMD4Q6IC98 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GRAMD4Q6IC98 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GRAMD4Q6IC98 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
GRAMD4Q6IC98 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
GRAMD4Q6IC98 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
GRAMD4Q6IC98 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GRAMD4Q6IC98 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GRAMD4Q6IC98 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
GRAMD4Q6IC98 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
GRAMD4Q6IC98 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
GRAMD4Q6IC98 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GRAMD4Q6IC98 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GRAMD4Q6IC98 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GRAMD4Q6IC98 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
GRAMD4Q6IC98 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GRAMD4Q6IC98 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
GRAMD4Q6IC98 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GRAMD4Q6IC98 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GRAMD4Q6IC98 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GRAMD4Q6IC98 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GRAMD4Q6IC98 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GRAMD4Q6IC98 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GRAMD4Q6IC98 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GRAMD4Q6IC98 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GRAMD4Q6IC98 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GRAMD4Q6IC98 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GRAMD4Q6IC98 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GRAMD4Q6IC98 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GRAMD4Q6IC98 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GRAMD4Q6IC98 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GRAMD4Q6IC98 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GRAMD4Q6IC98 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GRAMD4Q6IC98 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GRAMD4Q6IC98 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GRAMD4Q6IC98 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GRAMD4Q6IC98 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
GRAMD4Q6IC98 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GRAMD4Q6IC98 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
GRAMD4Q6IC98 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GRAMD4Q6IC98 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GRAMD4Q6IC98 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
GRAMD4Q6IC98 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
GRAMD4Q6IC98 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
GRAMD4Q6IC98 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GRAMD4Q6IC98 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.98■■□□□ 1.91
GRAMD4Q6IC98 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GRAMD4Q6IC98 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GRAMD4Q6IC98 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GRAMD4Q6IC98 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GRAMD4Q6IC98 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GRAMD4Q6IC98 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GRAMD4Q6IC98 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GRAMD4Q6IC98 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
GRAMD4Q6IC98 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
GRAMD4Q6IC98 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.95■■□□□ 1.9
GRAMD4Q6IC98 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
GRAMD4Q6IC98 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
GRAMD4Q6IC98 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
GRAMD4Q6IC98 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
GRAMD4Q6IC98 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GRAMD4Q6IC98 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GRAMD4Q6IC98 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GRAMD4Q6IC98 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GRAMD4Q6IC98 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
GRAMD4Q6IC98 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
GRAMD4Q6IC98 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GRAMD4Q6IC98 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GRAMD4Q6IC98 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GRAMD4Q6IC98 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
GRAMD4Q6IC98 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
GRAMD4Q6IC98 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
GRAMD4Q6IC98 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GRAMD4Q6IC98 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
GRAMD4Q6IC98 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
GRAMD4Q6IC98 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
GRAMD4Q6IC98 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GRAMD4Q6IC98 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
GRAMD4Q6IC98 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GRAMD4Q6IC98 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GRAMD4Q6IC98 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GRAMD4Q6IC98 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GRAMD4Q6IC98 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GRAMD4Q6IC98 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GRAMD4Q6IC98 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GRAMD4Q6IC98 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GRAMD4Q6IC98 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GRAMD4Q6IC98 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
GRAMD4Q6IC98 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GRAMD4Q6IC98 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GRAMD4Q6IC98 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
GRAMD4Q6IC98 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GRAMD4Q6IC98 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GRAMD4Q6IC98 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GRAMD4Q6IC98 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GRAMD4Q6IC98 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GRAMD4Q6IC98 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GRAMD4Q6IC98 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GRAMD4Q6IC98 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GRAMD4Q6IC98 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1373.7 ms