Protein–RNA interactions for Protein: Q6BDI9

REP15, Rab15 effector protein, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REP15Q6BDI9 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
REP15Q6BDI9 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
REP15Q6BDI9 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
REP15Q6BDI9 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
REP15Q6BDI9 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
REP15Q6BDI9 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
REP15Q6BDI9 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
REP15Q6BDI9 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
REP15Q6BDI9 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
REP15Q6BDI9 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
REP15Q6BDI9 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
REP15Q6BDI9 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
REP15Q6BDI9 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
REP15Q6BDI9 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
REP15Q6BDI9 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
REP15Q6BDI9 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
REP15Q6BDI9 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
REP15Q6BDI9 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
REP15Q6BDI9 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
REP15Q6BDI9 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
REP15Q6BDI9 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
REP15Q6BDI9 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
REP15Q6BDI9 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
REP15Q6BDI9 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
REP15Q6BDI9 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
REP15Q6BDI9 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
REP15Q6BDI9 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
REP15Q6BDI9 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
REP15Q6BDI9 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
REP15Q6BDI9 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
REP15Q6BDI9 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
REP15Q6BDI9 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
REP15Q6BDI9 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
REP15Q6BDI9 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
REP15Q6BDI9 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
REP15Q6BDI9 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
REP15Q6BDI9 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
REP15Q6BDI9 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
REP15Q6BDI9 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
REP15Q6BDI9 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
REP15Q6BDI9 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
REP15Q6BDI9 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
REP15Q6BDI9 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
REP15Q6BDI9 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
REP15Q6BDI9 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
REP15Q6BDI9 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
REP15Q6BDI9 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
REP15Q6BDI9 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
REP15Q6BDI9 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
REP15Q6BDI9 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
REP15Q6BDI9 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
REP15Q6BDI9 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
REP15Q6BDI9 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
REP15Q6BDI9 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
REP15Q6BDI9 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
REP15Q6BDI9 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
REP15Q6BDI9 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
REP15Q6BDI9 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
REP15Q6BDI9 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
REP15Q6BDI9 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
REP15Q6BDI9 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
REP15Q6BDI9 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
REP15Q6BDI9 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
REP15Q6BDI9 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
REP15Q6BDI9 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
REP15Q6BDI9 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
REP15Q6BDI9 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
REP15Q6BDI9 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
REP15Q6BDI9 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
REP15Q6BDI9 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
REP15Q6BDI9 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
REP15Q6BDI9 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
REP15Q6BDI9 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
REP15Q6BDI9 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
REP15Q6BDI9 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
REP15Q6BDI9 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
REP15Q6BDI9 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
REP15Q6BDI9 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
REP15Q6BDI9 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
REP15Q6BDI9 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
REP15Q6BDI9 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
REP15Q6BDI9 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
REP15Q6BDI9 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
REP15Q6BDI9 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
REP15Q6BDI9 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
REP15Q6BDI9 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
REP15Q6BDI9 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
REP15Q6BDI9 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
REP15Q6BDI9 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
REP15Q6BDI9 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
REP15Q6BDI9 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
REP15Q6BDI9 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
REP15Q6BDI9 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
REP15Q6BDI9 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
REP15Q6BDI9 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
REP15Q6BDI9 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
REP15Q6BDI9 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
REP15Q6BDI9 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
REP15Q6BDI9 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
REP15Q6BDI9 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 154.2 ms