Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWJ9

SNX30, Sorting nexin-30, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX30Q5VWJ9 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SNX30Q5VWJ9 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SNX30Q5VWJ9 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SNX30Q5VWJ9 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SNX30Q5VWJ9 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SNX30Q5VWJ9 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SNX30Q5VWJ9 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SNX30Q5VWJ9 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SNX30Q5VWJ9 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SNX30Q5VWJ9 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
SNX30Q5VWJ9 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SNX30Q5VWJ9 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SNX30Q5VWJ9 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SNX30Q5VWJ9 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SNX30Q5VWJ9 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SNX30Q5VWJ9 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SNX30Q5VWJ9 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SNX30Q5VWJ9 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SNX30Q5VWJ9 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SNX30Q5VWJ9 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SNX30Q5VWJ9 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SNX30Q5VWJ9 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SNX30Q5VWJ9 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SNX30Q5VWJ9 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SNX30Q5VWJ9 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SNX30Q5VWJ9 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
SNX30Q5VWJ9 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
SNX30Q5VWJ9 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SNX30Q5VWJ9 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SNX30Q5VWJ9 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SNX30Q5VWJ9 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SNX30Q5VWJ9 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SNX30Q5VWJ9 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SNX30Q5VWJ9 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SNX30Q5VWJ9 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SNX30Q5VWJ9 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
SNX30Q5VWJ9 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SNX30Q5VWJ9 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SNX30Q5VWJ9 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SNX30Q5VWJ9 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SNX30Q5VWJ9 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SNX30Q5VWJ9 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SNX30Q5VWJ9 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SNX30Q5VWJ9 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SNX30Q5VWJ9 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SNX30Q5VWJ9 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SNX30Q5VWJ9 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
SNX30Q5VWJ9 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SNX30Q5VWJ9 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SNX30Q5VWJ9 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
SNX30Q5VWJ9 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SNX30Q5VWJ9 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SNX30Q5VWJ9 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
SNX30Q5VWJ9 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SNX30Q5VWJ9 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SNX30Q5VWJ9 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SNX30Q5VWJ9 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
SNX30Q5VWJ9 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SNX30Q5VWJ9 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SNX30Q5VWJ9 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SNX30Q5VWJ9 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SNX30Q5VWJ9 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SNX30Q5VWJ9 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SNX30Q5VWJ9 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SNX30Q5VWJ9 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SNX30Q5VWJ9 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SNX30Q5VWJ9 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SNX30Q5VWJ9 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SNX30Q5VWJ9 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SNX30Q5VWJ9 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SNX30Q5VWJ9 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SNX30Q5VWJ9 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SNX30Q5VWJ9 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SNX30Q5VWJ9 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SNX30Q5VWJ9 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SNX30Q5VWJ9 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SNX30Q5VWJ9 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SNX30Q5VWJ9 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SNX30Q5VWJ9 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SNX30Q5VWJ9 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
SNX30Q5VWJ9 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SNX30Q5VWJ9 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SNX30Q5VWJ9 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SNX30Q5VWJ9 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SNX30Q5VWJ9 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SNX30Q5VWJ9 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SNX30Q5VWJ9 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
SNX30Q5VWJ9 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SNX30Q5VWJ9 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SNX30Q5VWJ9 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SNX30Q5VWJ9 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SNX30Q5VWJ9 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SNX30Q5VWJ9 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SNX30Q5VWJ9 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SNX30Q5VWJ9 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SNX30Q5VWJ9 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
SNX30Q5VWJ9 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SNX30Q5VWJ9 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SNX30Q5VWJ9 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SNX30Q5VWJ9 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.3 ms