Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV97

PERM1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PERM1Q5SV97 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PERM1Q5SV97 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PERM1Q5SV97 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PERM1Q5SV97 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PERM1Q5SV97 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PERM1Q5SV97 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PERM1Q5SV97 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PERM1Q5SV97 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PERM1Q5SV97 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
PERM1Q5SV97 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PERM1Q5SV97 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PERM1Q5SV97 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
PERM1Q5SV97 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
PERM1Q5SV97 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
PERM1Q5SV97 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PERM1Q5SV97 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PERM1Q5SV97 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PERM1Q5SV97 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PERM1Q5SV97 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PERM1Q5SV97 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PERM1Q5SV97 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PERM1Q5SV97 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PERM1Q5SV97 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PERM1Q5SV97 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PERM1Q5SV97 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PERM1Q5SV97 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PERM1Q5SV97 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
PERM1Q5SV97 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PERM1Q5SV97 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PERM1Q5SV97 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PERM1Q5SV97 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PERM1Q5SV97 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PERM1Q5SV97 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PERM1Q5SV97 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
PERM1Q5SV97 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PERM1Q5SV97 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PERM1Q5SV97 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PERM1Q5SV97 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PERM1Q5SV97 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PERM1Q5SV97 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PERM1Q5SV97 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PERM1Q5SV97 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PERM1Q5SV97 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PERM1Q5SV97 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PERM1Q5SV97 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PERM1Q5SV97 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PERM1Q5SV97 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PERM1Q5SV97 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PERM1Q5SV97 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PERM1Q5SV97 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PERM1Q5SV97 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PERM1Q5SV97 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PERM1Q5SV97 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PERM1Q5SV97 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PERM1Q5SV97 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PERM1Q5SV97 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PERM1Q5SV97 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PERM1Q5SV97 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PERM1Q5SV97 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PERM1Q5SV97 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PERM1Q5SV97 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PERM1Q5SV97 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PERM1Q5SV97 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PERM1Q5SV97 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PERM1Q5SV97 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
PERM1Q5SV97 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PERM1Q5SV97 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PERM1Q5SV97 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PERM1Q5SV97 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PERM1Q5SV97 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PERM1Q5SV97 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
PERM1Q5SV97 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PERM1Q5SV97 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PERM1Q5SV97 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PERM1Q5SV97 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PERM1Q5SV97 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PERM1Q5SV97 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PERM1Q5SV97 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PERM1Q5SV97 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PERM1Q5SV97 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PERM1Q5SV97 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PERM1Q5SV97 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PERM1Q5SV97 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PERM1Q5SV97 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PERM1Q5SV97 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PERM1Q5SV97 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PERM1Q5SV97 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PERM1Q5SV97 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PERM1Q5SV97 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PERM1Q5SV97 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PERM1Q5SV97 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PERM1Q5SV97 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PERM1Q5SV97 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PERM1Q5SV97 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PERM1Q5SV97 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PERM1Q5SV97 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PERM1Q5SV97 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PERM1Q5SV97 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PERM1Q5SV97 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PERM1Q5SV97 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.8 ms