Protein–RNA interactions for Protein: Q53GD3

SLC44A4, Choline transporter-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC44A4Q53GD3 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SLC44A4Q53GD3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SLC44A4Q53GD3 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SLC44A4Q53GD3 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SLC44A4Q53GD3 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SLC44A4Q53GD3 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SLC44A4Q53GD3 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SLC44A4Q53GD3 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SLC44A4Q53GD3 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SLC44A4Q53GD3 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SLC44A4Q53GD3 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
SLC44A4Q53GD3 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
SLC44A4Q53GD3 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
SLC44A4Q53GD3 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SLC44A4Q53GD3 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
SLC44A4Q53GD3 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
SLC44A4Q53GD3 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
SLC44A4Q53GD3 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
SLC44A4Q53GD3 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
SLC44A4Q53GD3 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
SLC44A4Q53GD3 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SLC44A4Q53GD3 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SLC44A4Q53GD3 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SLC44A4Q53GD3 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SLC44A4Q53GD3 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SLC44A4Q53GD3 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SLC44A4Q53GD3 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SLC44A4Q53GD3 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SLC44A4Q53GD3 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SLC44A4Q53GD3 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SLC44A4Q53GD3 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SLC44A4Q53GD3 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SLC44A4Q53GD3 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLC44A4Q53GD3 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC44A4Q53GD3 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SLC44A4Q53GD3 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLC44A4Q53GD3 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLC44A4Q53GD3 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SLC44A4Q53GD3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SLC44A4Q53GD3 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SLC44A4Q53GD3 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SLC44A4Q53GD3 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLC44A4Q53GD3 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLC44A4Q53GD3 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLC44A4Q53GD3 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SLC44A4Q53GD3 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SLC44A4Q53GD3 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SLC44A4Q53GD3 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SLC44A4Q53GD3 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SLC44A4Q53GD3 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SLC44A4Q53GD3 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SLC44A4Q53GD3 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLC44A4Q53GD3 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLC44A4Q53GD3 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SLC44A4Q53GD3 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SLC44A4Q53GD3 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SLC44A4Q53GD3 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SLC44A4Q53GD3 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SLC44A4Q53GD3 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLC44A4Q53GD3 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SLC44A4Q53GD3 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SLC44A4Q53GD3 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SLC44A4Q53GD3 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SLC44A4Q53GD3 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SLC44A4Q53GD3 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SLC44A4Q53GD3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SLC44A4Q53GD3 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SLC44A4Q53GD3 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SLC44A4Q53GD3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SLC44A4Q53GD3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SLC44A4Q53GD3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SLC44A4Q53GD3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SLC44A4Q53GD3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SLC44A4Q53GD3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SLC44A4Q53GD3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SLC44A4Q53GD3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SLC44A4Q53GD3 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SLC44A4Q53GD3 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SLC44A4Q53GD3 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SLC44A4Q53GD3 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SLC44A4Q53GD3 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLC44A4Q53GD3 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLC44A4Q53GD3 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
SLC44A4Q53GD3 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLC44A4Q53GD3 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLC44A4Q53GD3 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
SLC44A4Q53GD3 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLC44A4Q53GD3 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLC44A4Q53GD3 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SLC44A4Q53GD3 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SLC44A4Q53GD3 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SLC44A4Q53GD3 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SLC44A4Q53GD3 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SLC44A4Q53GD3 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLC44A4Q53GD3 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLC44A4Q53GD3 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SLC44A4Q53GD3 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SLC44A4Q53GD3 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC44A4Q53GD3 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC44A4Q53GD3 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms