Protein–RNA interactions for Protein: Q16822

PCK2, Phosphoenolpyruvate carboxykinase [GTP], mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCK2Q16822 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCK2Q16822 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCK2Q16822 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCK2Q16822 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PCK2Q16822 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCK2Q16822 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCK2Q16822 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCK2Q16822 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCK2Q16822 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PCK2Q16822 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PCK2Q16822 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCK2Q16822 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCK2Q16822 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCK2Q16822 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCK2Q16822 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCK2Q16822 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCK2Q16822 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCK2Q16822 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCK2Q16822 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCK2Q16822 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCK2Q16822 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCK2Q16822 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCK2Q16822 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCK2Q16822 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCK2Q16822 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCK2Q16822 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCK2Q16822 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCK2Q16822 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCK2Q16822 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCK2Q16822 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCK2Q16822 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCK2Q16822 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCK2Q16822 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PCK2Q16822 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCK2Q16822 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCK2Q16822 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCK2Q16822 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCK2Q16822 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCK2Q16822 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCK2Q16822 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCK2Q16822 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCK2Q16822 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCK2Q16822 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCK2Q16822 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PCK2Q16822 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCK2Q16822 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCK2Q16822 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCK2Q16822 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PCK2Q16822 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PCK2Q16822 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PCK2Q16822 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCK2Q16822 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCK2Q16822 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCK2Q16822 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCK2Q16822 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCK2Q16822 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCK2Q16822 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCK2Q16822 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCK2Q16822 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PCK2Q16822 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PCK2Q16822 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PCK2Q16822 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PCK2Q16822 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCK2Q16822 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCK2Q16822 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCK2Q16822 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCK2Q16822 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCK2Q16822 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCK2Q16822 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCK2Q16822 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCK2Q16822 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCK2Q16822 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCK2Q16822 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCK2Q16822 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCK2Q16822 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCK2Q16822 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCK2Q16822 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCK2Q16822 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCK2Q16822 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCK2Q16822 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCK2Q16822 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PCK2Q16822 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PCK2Q16822 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCK2Q16822 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCK2Q16822 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCK2Q16822 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PCK2Q16822 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCK2Q16822 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCK2Q16822 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCK2Q16822 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCK2Q16822 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCK2Q16822 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCK2Q16822 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCK2Q16822 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCK2Q16822 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCK2Q16822 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCK2Q16822 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCK2Q16822 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCK2Q16822 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCK2Q16822 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
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