Protein–RNA interactions for Protein: Q15629

TRAM1, Translocating chain-associated membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM1Q15629 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRAM1Q15629 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRAM1Q15629 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAM1Q15629 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAM1Q15629 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAM1Q15629 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAM1Q15629 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAM1Q15629 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAM1Q15629 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAM1Q15629 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAM1Q15629 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAM1Q15629 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAM1Q15629 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAM1Q15629 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAM1Q15629 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAM1Q15629 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAM1Q15629 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAM1Q15629 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAM1Q15629 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAM1Q15629 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAM1Q15629 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAM1Q15629 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAM1Q15629 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAM1Q15629 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAM1Q15629 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAM1Q15629 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAM1Q15629 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAM1Q15629 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAM1Q15629 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRAM1Q15629 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRAM1Q15629 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRAM1Q15629 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRAM1Q15629 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRAM1Q15629 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRAM1Q15629 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRAM1Q15629 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRAM1Q15629 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRAM1Q15629 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRAM1Q15629 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRAM1Q15629 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TRAM1Q15629 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRAM1Q15629 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAM1Q15629 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAM1Q15629 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAM1Q15629 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAM1Q15629 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAM1Q15629 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAM1Q15629 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAM1Q15629 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAM1Q15629 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAM1Q15629 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAM1Q15629 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAM1Q15629 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAM1Q15629 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAM1Q15629 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRAM1Q15629 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAM1Q15629 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAM1Q15629 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAM1Q15629 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAM1Q15629 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAM1Q15629 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAM1Q15629 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAM1Q15629 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAM1Q15629 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAM1Q15629 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAM1Q15629 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAM1Q15629 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAM1Q15629 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAM1Q15629 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAM1Q15629 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAM1Q15629 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRAM1Q15629 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRAM1Q15629 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRAM1Q15629 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRAM1Q15629 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRAM1Q15629 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRAM1Q15629 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAM1Q15629 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAM1Q15629 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAM1Q15629 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAM1Q15629 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAM1Q15629 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAM1Q15629 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAM1Q15629 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAM1Q15629 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAM1Q15629 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAM1Q15629 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAM1Q15629 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAM1Q15629 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAM1Q15629 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAM1Q15629 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAM1Q15629 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAM1Q15629 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAM1Q15629 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAM1Q15629 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAM1Q15629 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAM1Q15629 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAM1Q15629 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAM1Q15629 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAM1Q15629 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms