Protein–RNA interactions for Protein: Q15572

TAF1C, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1CQ15572 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
TAF1CQ15572 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
TAF1CQ15572 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
TAF1CQ15572 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.88■■■□□ 2.53
TAF1CQ15572 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
TAF1CQ15572 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
TAF1CQ15572 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
TAF1CQ15572 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
TAF1CQ15572 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC30.85■■■□□ 2.53
TAF1CQ15572 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
TAF1CQ15572 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
TAF1CQ15572 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
TAF1CQ15572 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
TAF1CQ15572 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
TAF1CQ15572 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
TAF1CQ15572 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
TAF1CQ15572 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
TAF1CQ15572 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
TAF1CQ15572 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
TAF1CQ15572 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.53
TAF1CQ15572 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
TAF1CQ15572 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
TAF1CQ15572 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
TAF1CQ15572 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
TAF1CQ15572 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
TAF1CQ15572 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
TAF1CQ15572 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
TAF1CQ15572 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
TAF1CQ15572 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
TAF1CQ15572 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
TAF1CQ15572 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
TAF1CQ15572 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
TAF1CQ15572 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
TAF1CQ15572 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
TAF1CQ15572 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
TAF1CQ15572 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
TAF1CQ15572 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
TAF1CQ15572 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
TAF1CQ15572 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
TAF1CQ15572 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
TAF1CQ15572 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.71■■■□□ 2.51
TAF1CQ15572 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
TAF1CQ15572 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
TAF1CQ15572 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
TAF1CQ15572 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
TAF1CQ15572 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
TAF1CQ15572 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
TAF1CQ15572 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
TAF1CQ15572 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
TAF1CQ15572 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
TAF1CQ15572 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
TAF1CQ15572 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
TAF1CQ15572 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
TAF1CQ15572 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
TAF1CQ15572 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
TAF1CQ15572 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
TAF1CQ15572 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
TAF1CQ15572 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
TAF1CQ15572 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
TAF1CQ15572 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
TAF1CQ15572 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
TAF1CQ15572 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC30.62■■■□□ 2.49
TAF1CQ15572 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
TAF1CQ15572 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC30.61■■■□□ 2.49
TAF1CQ15572 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
TAF1CQ15572 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
TAF1CQ15572 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
TAF1CQ15572 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC30.59■■■□□ 2.49
TAF1CQ15572 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC30.59■■■□□ 2.49
TAF1CQ15572 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC30.58■■■□□ 2.49
TAF1CQ15572 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
TAF1CQ15572 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC30.57■■■□□ 2.48
TAF1CQ15572 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
TAF1CQ15572 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
TAF1CQ15572 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
TAF1CQ15572 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
TAF1CQ15572 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC30.54■■■□□ 2.48
TAF1CQ15572 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
TAF1CQ15572 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
TAF1CQ15572 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
TAF1CQ15572 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
TAF1CQ15572 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.48
TAF1CQ15572 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC30.51■■■□□ 2.47
TAF1CQ15572 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
TAF1CQ15572 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
TAF1CQ15572 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
TAF1CQ15572 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
TAF1CQ15572 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
TAF1CQ15572 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
TAF1CQ15572 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
TAF1CQ15572 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
TAF1CQ15572 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
TAF1CQ15572 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
TAF1CQ15572 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
TAF1CQ15572 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
TAF1CQ15572 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC30.46■■■□□ 2.47
TAF1CQ15572 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
TAF1CQ15572 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
TAF1CQ15572 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
TAF1CQ15572 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
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