Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

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Length 657 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTPRRQ15256 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPRRQ15256 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPRRQ15256 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPRRQ15256 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPRRQ15256 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTPRRQ15256 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTPRRQ15256 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.84
PTPRRQ15256 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PTPRRQ15256 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
PTPRRQ15256 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTPRRQ15256 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTPRRQ15256 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PTPRRQ15256 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PTPRRQ15256 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
PTPRRQ15256 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
PTPRRQ15256 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PTPRRQ15256 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PTPRRQ15256 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTPRRQ15256 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTPRRQ15256 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTPRRQ15256 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PTPRRQ15256 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PTPRRQ15256 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PTPRRQ15256 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PTPRRQ15256 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PTPRRQ15256 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTPRRQ15256 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTPRRQ15256 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTPRRQ15256 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
PTPRRQ15256 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTPRRQ15256 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTPRRQ15256 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTPRRQ15256 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTPRRQ15256 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTPRRQ15256 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTPRRQ15256 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PTPRRQ15256 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PTPRRQ15256 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PTPRRQ15256 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PTPRRQ15256 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTPRRQ15256 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTPRRQ15256 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PTPRRQ15256 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PTPRRQ15256 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTPRRQ15256 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTPRRQ15256 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
PTPRRQ15256 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTPRRQ15256 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTPRRQ15256 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTPRRQ15256 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTPRRQ15256 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTPRRQ15256 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPRRQ15256 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPRRQ15256 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPRRQ15256 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPRRQ15256 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPRRQ15256 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPRRQ15256 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPRRQ15256 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPRRQ15256 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPRRQ15256 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPRRQ15256 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPRRQ15256 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPRRQ15256 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPRRQ15256 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPRRQ15256 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPRRQ15256 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTPRRQ15256 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTPRRQ15256 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTPRRQ15256 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTPRRQ15256 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPRRQ15256 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPRRQ15256 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPRRQ15256 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPRRQ15256 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPRRQ15256 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPRRQ15256 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPRRQ15256 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPRRQ15256 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPRRQ15256 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPRRQ15256 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPRRQ15256 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
PTPRRQ15256 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTPRRQ15256 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
PTPRRQ15256 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTPRRQ15256 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPRRQ15256 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPRRQ15256 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTPRRQ15256 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTPRRQ15256 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTPRRQ15256 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTPRRQ15256 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTPRRQ15256 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTPRRQ15256 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTPRRQ15256 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTPRRQ15256 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTPRRQ15256 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTPRRQ15256 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTPRRQ15256 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
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