Protein–RNA interactions for Protein: Q14088

RAB33A, Ras-related protein Rab-33A, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB33AQ14088 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RAB33AQ14088 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RAB33AQ14088 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RAB33AQ14088 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RAB33AQ14088 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RAB33AQ14088 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RAB33AQ14088 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
RAB33AQ14088 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RAB33AQ14088 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RAB33AQ14088 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RAB33AQ14088 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RAB33AQ14088 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
RAB33AQ14088 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RAB33AQ14088 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RAB33AQ14088 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RAB33AQ14088 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RAB33AQ14088 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
RAB33AQ14088 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RAB33AQ14088 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RAB33AQ14088 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RAB33AQ14088 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RAB33AQ14088 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RAB33AQ14088 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RAB33AQ14088 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RAB33AQ14088 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RAB33AQ14088 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
RAB33AQ14088 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
RAB33AQ14088 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RAB33AQ14088 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RAB33AQ14088 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RAB33AQ14088 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RAB33AQ14088 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RAB33AQ14088 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RAB33AQ14088 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RAB33AQ14088 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RAB33AQ14088 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RAB33AQ14088 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RAB33AQ14088 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RAB33AQ14088 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.86■■■□□ 2.05
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RAB33AQ14088 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RAB33AQ14088 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RAB33AQ14088 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RAB33AQ14088 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RAB33AQ14088 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RAB33AQ14088 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RAB33AQ14088 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RAB33AQ14088 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
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RAB33AQ14088 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
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RAB33AQ14088 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RAB33AQ14088 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RAB33AQ14088 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RAB33AQ14088 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
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RAB33AQ14088 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
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RAB33AQ14088 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RAB33AQ14088 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RAB33AQ14088 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RAB33AQ14088 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RAB33AQ14088 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RAB33AQ14088 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RAB33AQ14088 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RAB33AQ14088 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RAB33AQ14088 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RAB33AQ14088 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RAB33AQ14088 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RAB33AQ14088 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RAB33AQ14088 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RAB33AQ14088 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RAB33AQ14088 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RAB33AQ14088 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
RAB33AQ14088 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
RAB33AQ14088 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RAB33AQ14088 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RAB33AQ14088 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RAB33AQ14088 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RAB33AQ14088 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RAB33AQ14088 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RAB33AQ14088 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
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