Protein–RNA interactions for Protein: Q13491

GPM6B, Neuronal membrane glycoprotein M6-b, humanhuman

Predictions only

Length 265 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPM6BQ13491 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
GPM6BQ13491 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
GPM6BQ13491 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
GPM6BQ13491 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
GPM6BQ13491 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
GPM6BQ13491 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
GPM6BQ13491 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GPM6BQ13491 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
GPM6BQ13491 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
GPM6BQ13491 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
GPM6BQ13491 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
GPM6BQ13491 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
GPM6BQ13491 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
GPM6BQ13491 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
GPM6BQ13491 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
GPM6BQ13491 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
GPM6BQ13491 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
GPM6BQ13491 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
GPM6BQ13491 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GPM6BQ13491 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GPM6BQ13491 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GPM6BQ13491 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GPM6BQ13491 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GPM6BQ13491 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GPM6BQ13491 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GPM6BQ13491 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GPM6BQ13491 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GPM6BQ13491 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
GPM6BQ13491 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
GPM6BQ13491 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
GPM6BQ13491 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
GPM6BQ13491 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
GPM6BQ13491 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GPM6BQ13491 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
GPM6BQ13491 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
GPM6BQ13491 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
GPM6BQ13491 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GPM6BQ13491 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
GPM6BQ13491 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GPM6BQ13491 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
GPM6BQ13491 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
GPM6BQ13491 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
GPM6BQ13491 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
GPM6BQ13491 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
GPM6BQ13491 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
GPM6BQ13491 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
GPM6BQ13491 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
GPM6BQ13491 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GPM6BQ13491 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
GPM6BQ13491 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
GPM6BQ13491 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GPM6BQ13491 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GPM6BQ13491 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GPM6BQ13491 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
GPM6BQ13491 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GPM6BQ13491 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GPM6BQ13491 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
GPM6BQ13491 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GPM6BQ13491 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
GPM6BQ13491 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GPM6BQ13491 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GPM6BQ13491 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
GPM6BQ13491 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
GPM6BQ13491 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
GPM6BQ13491 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
GPM6BQ13491 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
GPM6BQ13491 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
GPM6BQ13491 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
GPM6BQ13491 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
GPM6BQ13491 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
GPM6BQ13491 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GPM6BQ13491 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
GPM6BQ13491 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
GPM6BQ13491 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GPM6BQ13491 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
GPM6BQ13491 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
GPM6BQ13491 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
GPM6BQ13491 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.09
GPM6BQ13491 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GPM6BQ13491 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
GPM6BQ13491 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
GPM6BQ13491 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
GPM6BQ13491 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
GPM6BQ13491 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GPM6BQ13491 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GPM6BQ13491 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GPM6BQ13491 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
GPM6BQ13491 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
GPM6BQ13491 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
GPM6BQ13491 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
GPM6BQ13491 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GPM6BQ13491 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
GPM6BQ13491 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GPM6BQ13491 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
GPM6BQ13491 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
GPM6BQ13491 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GPM6BQ13491 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GPM6BQ13491 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GPM6BQ13491 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
GPM6BQ13491 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
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