Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
TCIRG1Q13488 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
TCIRG1Q13488 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
TCIRG1Q13488 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
TCIRG1Q13488 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC33.41■■■□□ 2.94
TCIRG1Q13488 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
TCIRG1Q13488 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
TCIRG1Q13488 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
TCIRG1Q13488 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
TCIRG1Q13488 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
TCIRG1Q13488 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
TCIRG1Q13488 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
TCIRG1Q13488 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
TCIRG1Q13488 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
TCIRG1Q13488 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
TCIRG1Q13488 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
TCIRG1Q13488 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
TCIRG1Q13488 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC33.35■■■□□ 2.93
TCIRG1Q13488 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC33.35■■■□□ 2.93
TCIRG1Q13488 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
TCIRG1Q13488 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC33.33■■■□□ 2.93
TCIRG1Q13488 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
TCIRG1Q13488 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
TCIRG1Q13488 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
TCIRG1Q13488 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
TCIRG1Q13488 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
TCIRG1Q13488 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
TCIRG1Q13488 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
TCIRG1Q13488 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
TCIRG1Q13488 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
TCIRG1Q13488 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
TCIRG1Q13488 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
TCIRG1Q13488 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC33.28■■■□□ 2.92
TCIRG1Q13488 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
TCIRG1Q13488 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
TCIRG1Q13488 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
TCIRG1Q13488 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
TCIRG1Q13488 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
TCIRG1Q13488 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
TCIRG1Q13488 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC33.25■■■□□ 2.91
TCIRG1Q13488 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
TCIRG1Q13488 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
TCIRG1Q13488 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.24■■■□□ 2.91
TCIRG1Q13488 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
TCIRG1Q13488 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
TCIRG1Q13488 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
TCIRG1Q13488 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
TCIRG1Q13488 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.21■■■□□ 2.91
TCIRG1Q13488 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
TCIRG1Q13488 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
TCIRG1Q13488 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
TCIRG1Q13488 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
TCIRG1Q13488 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC33.19■■■□□ 2.9
TCIRG1Q13488 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
TCIRG1Q13488 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
TCIRG1Q13488 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
TCIRG1Q13488 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
TCIRG1Q13488 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
TCIRG1Q13488 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
TCIRG1Q13488 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
TCIRG1Q13488 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
TCIRG1Q13488 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
TCIRG1Q13488 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
TCIRG1Q13488 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
TCIRG1Q13488 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
TCIRG1Q13488 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
TCIRG1Q13488 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
TCIRG1Q13488 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
TCIRG1Q13488 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
TCIRG1Q13488 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
TCIRG1Q13488 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
TCIRG1Q13488 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
TCIRG1Q13488 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
TCIRG1Q13488 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
TCIRG1Q13488 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
TCIRG1Q13488 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
TCIRG1Q13488 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
TCIRG1Q13488 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC33.1■■■□□ 2.89
TCIRG1Q13488 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
TCIRG1Q13488 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
TCIRG1Q13488 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
TCIRG1Q13488 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
TCIRG1Q13488 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
TCIRG1Q13488 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
TCIRG1Q13488 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
TCIRG1Q13488 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
TCIRG1Q13488 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
TCIRG1Q13488 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
TCIRG1Q13488 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
TCIRG1Q13488 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
TCIRG1Q13488 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC33.05■■■□□ 2.88
TCIRG1Q13488 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
TCIRG1Q13488 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
TCIRG1Q13488 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
TCIRG1Q13488 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
TCIRG1Q13488 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
TCIRG1Q13488 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
TCIRG1Q13488 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
TCIRG1Q13488 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
TCIRG1Q13488 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
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